More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0095 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
305 aa  630  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  66.01 
 
 
305 aa  431  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  42.46 
 
 
287 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  47.26 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  42.07 
 
 
287 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  38.59 
 
 
300 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2990  alpha/beta hydrolase fold protein  38.41 
 
 
322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  hitchhiker  0.00172435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  40.61 
 
 
281 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 
300 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 
300 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 
300 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  35.38 
 
 
316 aa  162  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
287 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 
307 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  31.83 
 
 
290 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 
301 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
291 aa  159  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  34.6 
 
 
301 aa  155  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
288 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 
289 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 
289 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 
284 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
287 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
349 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 
308 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 
305 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 
307 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
300 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  33.78 
 
 
289 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 
308 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
297 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 
308 aa  149  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  34.83 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
304 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
287 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
299 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
288 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
298 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  30.74 
 
 
308 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  32.53 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
286 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.42 
 
 
293 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
303 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
299 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 
287 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  34.04 
 
 
306 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0714  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 
306 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0301539  normal  0.0245198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  34.69 
 
 
296 aa  135  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 
300 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.65 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 
308 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 
297 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  34.7 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  32.88 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  32.88 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  32.88 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  32.88 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  32.88 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  32.88 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  32.53 
 
 
298 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 
291 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 
296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
296 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  34.12 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 
356 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
307 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
315 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
293 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
323 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  34.97 
 
 
294 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
293 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 
293 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
310 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54746  soluble epoxide hydrolase  31.47 
 
 
321 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  32.08 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  31.27 
 
 
494 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  29.55 
 
 
347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
324 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
347 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
293 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 
323 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 
323 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>