More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2968 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2968  response regulator receiver and unknown domain protein  100 
 
 		 228 aa  453  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  48.2 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  44.25 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  45.06 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  42.49 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  47.98 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  43.36 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  44.39 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4415  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.59 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1769  response regulator receiver and unknown domain-containing protein  50 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.870814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  45.18 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.3 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  41.15 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  42.41 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3357  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.81 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0517  two component transcriptional regulator, Fis family  41.56 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.169907  normal  0.0442424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  42.53 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  40 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0520  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.61 
 
 		 272 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14110  response regulator of citrate/malate metabolism  41.48 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0325971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  34.22 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4178  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.12 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4244  Fis family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0391426  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4400  Fis family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  41.59 
 
 		 226 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  38.77 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5078  response regulator receiver and unknown domain protein  43.33 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.763511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.99 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.99 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.99 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  36.52 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  29.91 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  31.08 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  30.77 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  40.53 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.01 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.94 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  29.86 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  29.41 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  29.41 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  29.41 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  29.41 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2037  response regulator receiver  37.5 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  34.08 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  38.57 
 
 		 224 aa  118  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  28.96 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  30.53 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  35.14 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  32.44 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  34.68 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  35.14 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.26 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4698  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.99 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.423451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.63 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0577  response regulator  29.67 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  29.55 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  29.55 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  32.17 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2791  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  27.35 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00727267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.4 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  31.22 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  30.63 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.82 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  29.86 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  29.41 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  31.05 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  29.41 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  30.18 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0349  response regulator receiver  27.68 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  29.73 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  29.73 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  33.18 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1346  response regulator receiver and unknown domain protein  35.75 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000367941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1303  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.49 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.73 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  31.05 
 
 		 225 aa  98.2  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  29.41 
 
 		 225 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.79 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.79 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  29.41 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.79 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  29.82 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  29.41 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.14 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.78 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  29.41 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.79 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  32.43 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.14 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  32.13 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  32.13 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1452  response regulator receiver and unknown domain protein  28.7 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.72 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.96 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.29 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  30.57 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  30.8 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  30.57 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  28.94 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  30.67 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>