More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1608 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 243 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  47.5 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  49.25 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  44.61 
 
 		 203 aa  148  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  45 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  44.9 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  41.5 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  44.71 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  44.34 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  44.04 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  41.79 
 
 		 204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  45.22 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  40.93 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  44.78 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  44.33 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  44.72 
 
 		 200 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  42.92 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  41.95 
 
 		 204 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  45.33 
 
 		 228 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  41.15 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  40.99 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  40.99 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  40.99 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  41.58 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  43.35 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  40.64 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.24 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  40.45 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  39.6 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  39.25 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  38.18 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 		 214 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  41.03 
 
 		 205 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  35.51 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  41.72 
 
 		 205 aa  98.6  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  42.5 
 
 		 226 aa  98.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 194 aa  98.6  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  42.5 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  37.61 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  32.75 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  42.6 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  36.79 
 
 		 223 aa  95.5  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.75 
 
 		 442 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  40.57 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  47.86 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.75 
 
 		 442 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  31.7 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  44.25 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  39.67 
 
 		 220 aa  92.8  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  42.67 
 
 		 222 aa  92  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  42.67 
 
 		 222 aa  92  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  38.34 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30400  predicted protein  37.07 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.923581 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  37.09 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  38.01 
 
 		 402 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.72 
 
 		 427 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  44.25 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  40.7 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  36.02 
 
 		 193 aa  88.6  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.13 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 459 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 		 411 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  41.53 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  35.42 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 190 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 210 aa  87  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  37.64 
 
 		 197 aa  87  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.14 
 
 		 442 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  40.36 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  39.77 
 
 		 200 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>