More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1502 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
420 aa  863    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  48.4 
 
 
403 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  47.62 
 
 
407 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  46.36 
 
 
412 aa  353  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  39.45 
 
 
517 aa  285  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  36.61 
 
 
412 aa  272  9e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  39.05 
 
 
441 aa  270  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  36.23 
 
 
408 aa  263  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  37.53 
 
 
418 aa  259  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
421 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
408 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 
410 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  33.92 
 
 
413 aa  210  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
427 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
407 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.4 
 
 
409 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  28.78 
 
 
421 aa  206  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
423 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
405 aa  200  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
404 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
421 aa  196  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  32.35 
 
 
417 aa  195  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  28.92 
 
 
429 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 
409 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
403 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
424 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
424 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 
413 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  26.56 
 
 
413 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
409 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 
413 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 
413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
415 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  27.65 
 
 
397 aa  166  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
407 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  29.1 
 
 
475 aa  162  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
423 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
411 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
436 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  27.03 
 
 
390 aa  160  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  27.16 
 
 
417 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  28.79 
 
 
416 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
402 aa  156  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
422 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
442 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
419 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
416 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
566 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
415 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
412 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
405 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  27.83 
 
 
415 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
416 aa  143  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  30.28 
 
 
428 aa  143  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
457 aa  142  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.22 
 
 
404 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
431 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
414 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  24.57 
 
 
388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  25 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
406 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  25.61 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  26.59 
 
 
450 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  26.7 
 
 
415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
411 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
412 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  25.36 
 
 
410 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
416 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  26.41 
 
 
420 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  26.29 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  24.14 
 
 
401 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  24.03 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  22.44 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  24.37 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
422 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  23.79 
 
 
407 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
411 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  23.79 
 
 
407 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  23.54 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  23.54 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
425 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
418 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 
423 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0166  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
398 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  28.79 
 
 
390 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
427 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  24.01 
 
 
407 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
405 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
416 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
405 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>