More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2629 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
465 aa  916    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  69.38 
 
 
434 aa  565  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  64.72 
 
 
455 aa  559  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  65.65 
 
 
454 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  45.64 
 
 
425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  42.48 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 
421 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 
421 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  43.12 
 
 
442 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 
415 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  36.34 
 
 
410 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  37.63 
 
 
412 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  37.47 
 
 
412 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  37.44 
 
 
410 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  31.9 
 
 
404 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
416 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  31.22 
 
 
411 aa  176  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  30.4 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.25 
 
 
418 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
405 aa  160  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
408 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  31.79 
 
 
412 aa  156  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  31.74 
 
 
418 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  32.87 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
407 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
405 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 
407 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  30.95 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  29.25 
 
 
408 aa  141  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  28.27 
 
 
402 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 
433 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.1 
 
 
402 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  28.9 
 
 
412 aa  137  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.82 
 
 
402 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.82 
 
 
402 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  28.27 
 
 
402 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  29.29 
 
 
413 aa  136  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  28.19 
 
 
402 aa  136  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  28.46 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  28.46 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  28.46 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  27.82 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  26.33 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  28.01 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  28.01 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  28.01 
 
 
402 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  28.01 
 
 
402 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.58 
 
 
402 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  27.95 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.34 
 
 
402 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.95 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
398 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
398 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  32 
 
 
404 aa  130  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  26.73 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.86 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  27.1 
 
 
402 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
453 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  27.57 
 
 
406 aa  126  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  29.49 
 
 
438 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  27.79 
 
 
442 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  25.45 
 
 
467 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  25.95 
 
 
467 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
467 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  28.08 
 
 
400 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  27.9 
 
 
402 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  26.4 
 
 
467 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  27.47 
 
 
437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  28.33 
 
 
429 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
407 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  24.47 
 
 
436 aa  118  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  28.61 
 
 
437 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  27.8 
 
 
400 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  27.63 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  27.27 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  27.88 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  27.8 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  25.99 
 
 
436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  29.18 
 
 
437 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  26.86 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  28.5 
 
 
475 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  27.03 
 
 
433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
424 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
432 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  25.97 
 
 
424 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  24.38 
 
 
428 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>