More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0568 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
503 aa  1015    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
660 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
473 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
452 aa  171  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
619 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
441 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
1255 aa  157  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
452 aa  157  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
619 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  30.74 
 
 
529 aa  154  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
469 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
408 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
930 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
514 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
412 aa  146  9e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
409 aa  145  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
780 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
452 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  27.83 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
701 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
360 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
403 aa  140  7e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  30.2 
 
 
553 aa  139  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  30.35 
 
 
532 aa  139  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
441 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
458 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  27.85 
 
 
572 aa  136  9e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  29.37 
 
 
540 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
780 aa  135  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.08 
 
 
1306 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
751 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
1341 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
556 aa  133  7.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
1171 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
751 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  31.51 
 
 
246 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
756 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
741 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
675 aa  130  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
933 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  29.48 
 
 
542 aa  130  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
666 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
773 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  29.37 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
635 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
554 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  30.23 
 
 
813 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  30.74 
 
 
516 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  29.89 
 
 
552 aa  125  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
1171 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
712 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  27.31 
 
 
394 aa  123  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  29.09 
 
 
696 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
839 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  28.46 
 
 
728 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1439  histidine kinase  34.22 
 
 
577 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  30.47 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1379  histidine kinase  32.44 
 
 
579 aa  114  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138084  normal  0.0193369 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  25.2 
 
 
740 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
475 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 
752 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  29.66 
 
 
465 aa  109  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.86 
 
 
753 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
434 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  25.66 
 
 
856 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  26.83 
 
 
616 aa  106  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.67 
 
 
491 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1665  sensory box sensor histidine kinase, putative  25.77 
 
 
403 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  25.82 
 
 
617 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1484  sensory box sensor histidine kinase, putative  25.38 
 
 
403 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
592 aa  104  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  27.79 
 
 
667 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  26.38 
 
 
687 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
671 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.918325 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 
646 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  29.76 
 
 
689 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
492 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
613 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
780 aa  96.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  26.4 
 
 
646 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  25.55 
 
 
516 aa  93.6  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  25 
 
 
584 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  26.61 
 
 
468 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
676 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  29.36 
 
 
907 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
729 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
627 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
638 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 
662 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 
480 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  28.36 
 
 
676 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  24.04 
 
 
508 aa  91.7  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  22.77 
 
 
517 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
631 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
591 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2152  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
834 aa  90.9  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.116633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>