More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3306 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  100 
 
 		 384 aa  771    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  74.48 
 
 		 387 aa  567  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  74.8 
 
 		 382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  74.8 
 
 		 382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  74.8 
 
 		 382 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  74.8 
 
 		 382 aa  555  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  71.5 
 
 		 387 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  67.01 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  64.49 
 
 		 386 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  68.41 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  59.05 
 
 		 404 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  58.78 
 
 		 392 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  54.11 
 
 		 404 aa  423  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  56.17 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  57.54 
 
 		 398 aa  423  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  57.95 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  55.67 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  60.61 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  54.96 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  58.47 
 
 		 386 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  56.68 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  54.66 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  58.71 
 
 		 409 aa  398  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  57.39 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  57.97 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  55.64 
 
 		 411 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  50.87 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  49.63 
 
 		 416 aa  371  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  54.39 
 
 		 409 aa  368  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  47.01 
 
 		 404 aa  359  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  45.93 
 
 		 406 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  42.14 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 672 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  34.84 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 536 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 		 405 aa  113  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 391 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.04 
 
 		 423 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.05 
 
 		 650 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 419 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  31.08 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.51 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  30.37 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 448 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.87 
 
 		 935 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  33.23 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3449  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.455826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 437 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 437 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 396 aa  99.8  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  30.48 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 414 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  33.65 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  30.94 
 
 		 417 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.75 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  33.65 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>