More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0083 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0083  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 525 aa  1045    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  50.19 
 
 		 557 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6131  AMP-dependent synthetase and ligase  50.66 
 
 		 557 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0231902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20370  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  55.71 
 
 		 504 aa  496  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3235  AMP-dependent synthetase and ligase  49.81 
 
 		 530 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  46.23 
 
 		 561 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  45.74 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  45.54 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  45.32 
 
 		 547 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  45.51 
 
 		 555 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  46.46 
 
 		 556 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  45.76 
 
 		 557 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  45.72 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  48.25 
 
 		 563 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  44.04 
 
 		 562 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  46.08 
 
 		 555 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  46.08 
 
 		 555 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  45.71 
 
 		 557 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  44.63 
 
 		 555 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  44.73 
 
 		 555 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  43.56 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  43.74 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  46.1 
 
 		 539 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.861325  hitchhiker  0.000258347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  43.8 
 
 		 553 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3109  AMP-dependent synthetase and ligase  43.31 
 
 		 557 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  43.88 
 
 		 563 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  41.79 
 
 		 554 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  42.76 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  42.4 
 
 		 552 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  41.33 
 
 		 552 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0821  acetyl-CoA synthetase  40.73 
 
 		 569 aa  365  1e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325242 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  39.24 
 
 		 554 aa  363  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0838  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 		 573 aa  363  4e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1546  putative acyl-CoA synthetase  40.23 
 
 		 510 aa  349  7e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  37.42 
 
 		 572 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  37.8 
 
 		 572 aa  294  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  37.65 
 
 		 572 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  37.65 
 
 		 572 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  37.6 
 
 		 572 aa  293  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  37.6 
 
 		 572 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  37.6 
 
 		 572 aa  292  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  37.6 
 
 		 572 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  37.6 
 
 		 572 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  37.6 
 
 		 572 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  37.4 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  35.11 
 
 		 568 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  35.11 
 
 		 568 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  35.83 
 
 		 571 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  38.72 
 
 		 587 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 		 560 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  37.34 
 
 		 576 aa  280  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  37.23 
 
 		 607 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 537 aa  277  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  34.27 
 
 		 571 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  35.47 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  35.57 
 
 		 588 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  36.31 
 
 		 588 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  36.31 
 
 		 588 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 530 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  37.18 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  36.55 
 
 		 588 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 530 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 539 aa  270  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 539 aa  270  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 		 562 aa  270  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 598 aa  266  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  36.25 
 
 		 585 aa  266  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 		 528 aa  266  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 522 aa  266  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 576 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  35.5 
 
 		 592 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  35.64 
 
 		 602 aa  261  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 609 aa  261  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  33.99 
 
 		 528 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.99 
 
 		 528 aa  259  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  33.86 
 
 		 522 aa  259  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  33.79 
 
 		 528 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.99 
 
 		 528 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  38.42 
 
 		 544 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  33.99 
 
 		 522 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4225  AMP-dependent synthetase and ligase  37.84 
 
 		 508 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217524  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 571 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 576 aa  258  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  33.79 
 
 		 528 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  33.6 
 
 		 528 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 595 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 528 aa  257  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  33.94 
 
 		 584 aa  256  6e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 		 538 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 552 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  36.46 
 
 		 551 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  33.33 
 
 		 563 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  33.6 
 
 		 528 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 		 543 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  30.55 
 
 		 626 aa  250  3e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 543 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  36.65 
 
 		 549 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>