More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1855 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 356 aa  739    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  84.27 
 
 		 356 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  61.25 
 
 		 349 aa  441  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  62.11 
 
 		 349 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  62.39 
 
 		 349 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  62.39 
 
 		 349 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  62.39 
 
 		 349 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  62.39 
 
 		 349 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  62.39 
 
 		 349 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  62.39 
 
 		 349 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  62.39 
 
 		 349 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  62.39 
 
 		 349 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  61.82 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  34.53 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  34.8 
 
 		 355 aa  195  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 		 367 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  32.42 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  34.1 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  29.95 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  31.19 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  35.21 
 
 		 279 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  29.04 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  31.12 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  30.56 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 435 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  29.5 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  29.18 
 
 		 345 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  33.62 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  29.78 
 
 		 372 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  35.24 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  29.15 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  29.57 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  27.7 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  29.47 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  26.98 
 
 		 352 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  28.05 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  28.53 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  27.48 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  28.06 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  28.12 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0758  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  28.52 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000573305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  28.65 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  27.68 
 
 		 354 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0772  quinol oxidase, subunit II  28.52 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0669  quinol oxidase subunit II  28.52 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0613  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  28.52 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0614  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  28.52 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0591  quinol oxidase AA3, subunit II  30.48 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0830  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  28.52 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0703  quinol oxidase subunit II  28.52 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  25.97 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0737  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  29.15 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0350513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4600  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  28.15 
 
 		 291 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  25.23 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  32.74 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  26.85 
 
 		 353 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  26.57 
 
 		 520 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  26.19 
 
 		 401 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  26.19 
 
 		 401 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  26.73 
 
 		 314 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  26.84 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  27.98 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  26.2 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  29.64 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  26.54 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  25.9 
 
 		 512 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  26.62 
 
 		 513 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  26.26 
 
 		 513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  26.26 
 
 		 513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  27.14 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  26.98 
 
 		 518 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  30.04 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  32.43 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  26.62 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  25.89 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  26.62 
 
 		 518 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  26.16 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  29.33 
 
 		 370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  30.3 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  26.26 
 
 		 513 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  26.62 
 
 		 518 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  25.49 
 
 		 524 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  27.54 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  28.66 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  25.57 
 
 		 511 aa  116  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  27.21 
 
 		 528 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0511  cytochrome c oxidase subunit II  30.6 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.263206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  27.11 
 
 		 373 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  26.8 
 
 		 524 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  27.24 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  26.06 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0646  quinol oxidase, subunit II  30.04 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  25.96 
 
 		 519 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  27.86 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  28.01 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  31.36 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  24.46 
 
 		 521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  27.55 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>