More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1900 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  85.49 
 
 		 255 aa  454  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  81.25 
 
 		 258 aa  434  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  74.41 
 
 		 258 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  74.02 
 
 		 258 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  46.99 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  42.35 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  44.94 
 
 		 246 aa  195  7e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  40.68 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  40.68 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  39.45 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  39.04 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  40 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  41.41 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  37.5 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  40.68 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  36.33 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  38.78 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  46.45 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  40.71 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  40.32 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  38.22 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  37.65 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  37.45 
 
 		 261 aa  174  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  39.72 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  43.32 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  44.81 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  41.47 
 
 		 264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  38.34 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  36.43 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  38.58 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  39.92 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  40.91 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  36.73 
 
 		 382 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  39.17 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  39.75 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  38.89 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  43.5 
 
 		 375 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  34.96 
 
 		 269 aa  164  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  40.91 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  34.47 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  35.16 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  38.04 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  40.56 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  39.45 
 
 		 386 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  39.72 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  39.91 
 
 		 270 aa  161  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  37.94 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  38.08 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  38.08 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  40.43 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  38.08 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  38.97 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  38.86 
 
 		 380 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  36.69 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  35.74 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  37.75 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  34.68 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  31.75 
 
 		 383 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  38 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  34.24 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  36 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  36.73 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  38 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  35.8 
 
 		 372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  39.8 
 
 		 377 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  34.12 
 
 		 413 aa  152  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  38.78 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  34.23 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  34.25 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  36.11 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  34.25 
 
 		 374 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  38.43 
 
 		 253 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  34.75 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  33.06 
 
 		 376 aa  148  8e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  34.63 
 
 		 364 aa  148  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  36.82 
 
 		 366 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  36.08 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  36.57 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  36.57 
 
 		 366 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  36.08 
 
 		 447 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  33.99 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  35.87 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  34.41 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  34.48 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  37.68 
 
 		 261 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  32.95 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  38.53 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  35.69 
 
 		 384 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  34.8 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 		 374 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  33.46 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  37.5 
 
 		 374 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  33.2 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  35.87 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  37.5 
 
 		 374 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  39.07 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  36.02 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  35.83 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.496882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>