More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3142 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
434 aa  853  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  74.27 
 
 
455 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  72.71 
 
 
454 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  69.23 
 
 
465 aa  544  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
425 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  41.73 
 
 
442 aa  283  5e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  39.53 
 
 
421 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 
415 aa  275  1e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 
421 aa  275  1e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
421 aa  274  2e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  36 
 
 
410 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  35.29 
 
 
412 aa  259  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.77663e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  34.75 
 
 
412 aa  256  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  35.6 
 
 
410 aa  254  2e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  33.96 
 
 
404 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  34.26 
 
 
412 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
416 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  31.41 
 
 
397 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.75 
 
 
408 aa  157  5e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
407 aa  157  5e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  29.12 
 
 
411 aa  156  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
407 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
405 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  32.44 
 
 
418 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
405 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  31.84 
 
 
391 aa  149  1e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.43521e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  27.21 
 
 
418 aa  148  2e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  29.84 
 
 
402 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  29.66 
 
 
400 aa  147  4e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  27.55 
 
 
402 aa  147  4e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  29.24 
 
 
402 aa  147  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  27.31 
 
 
402 aa  146  8e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.11684e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  28.98 
 
 
402 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.31 
 
 
402 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  28.98 
 
 
402 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.31 
 
 
402 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.55 
 
 
402 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  28.98 
 
 
400 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  28.98 
 
 
402 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  28.98 
 
 
400 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  28.98 
 
 
402 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  28.98 
 
 
402 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  31.16 
 
 
419 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.31 
 
 
402 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83174e-08 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 
408 aa  142  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.79 
 
 
402 aa  142  1e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.56 
 
 
402 aa  141  2e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
414 aa  142  2e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.1703e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.62 
 
 
402 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.21238e-05 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.62 
 
 
402 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
433 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  29.38 
 
 
400 aa  135  2e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
421 aa  131  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  28.9 
 
 
412 aa  131  2e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  29.07 
 
 
400 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.96 
 
 
398 aa  130  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.96 
 
 
398 aa  130  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  28.08 
 
 
413 aa  129  8e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  29.17 
 
 
402 aa  128  2e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  26.49 
 
 
424 aa  129  2e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  26.73 
 
 
398 aa  128  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  26.73 
 
 
398 aa  128  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  26.73 
 
 
398 aa  128  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  29.49 
 
 
400 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  30.83 
 
 
404 aa  127  4e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  29.26 
 
 
400 aa  126  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  28.41 
 
 
400 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  28.41 
 
 
400 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
421 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  28.41 
 
 
400 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  28.41 
 
 
400 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  28.41 
 
 
400 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  27.49 
 
 
424 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  28.3 
 
 
401 aa  122  9e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  29.68 
 
 
442 aa  122  1e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  26.53 
 
 
430 aa  119  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  26.82 
 
 
438 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  2.66277e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
407 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  27.27 
 
 
429 aa  116  7e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  25.93 
 
 
436 aa  115  2e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  27.27 
 
 
437 aa  114  2e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  26.41 
 
 
428 aa  115  2e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
430 aa  115  2e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
436 aa  115  2e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
436 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  25.79 
 
 
467 aa  114  4e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  26.09 
 
 
406 aa  114  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
467 aa  112  1e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  27.43 
 
 
437 aa  111  2e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  24.8 
 
 
436 aa  111  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 
429 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
424 aa  110  4e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  26.46 
 
 
467 aa  110  4e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2467  putative oxalate:formate antiporter  30.22 
 
 
358 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.34244e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0061  major facilitator transporter  26.86 
 
 
414 aa  110  7e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0161323  hitchhiker  0.000519908 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  23.95 
 
 
467 aa  110  7e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0056  major facilitator transporter  26.86 
 
 
414 aa  110  7e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4298  major facilitator transporter  26.77 
 
 
414 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000777962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0060  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
414 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  27.36 
 
 
431 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>