More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2495 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 
855 aa  649  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 
885 aa  639  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68418e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 
857 aa  681  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  6.09956e-10 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 
853 aa  637  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 
853 aa  642  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  41.85 
 
 
851 aa  645  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  48.46 
 
 
882 aa  728  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  43.65 
 
 
880 aa  677  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  46.85 
 
 
867 aa  765  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 
890 aa  685  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  41.73 
 
 
851 aa  644  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  42.46 
 
 
859 aa  670  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 
932 aa  822  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
856 aa  688  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 
855 aa  642  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 
858 aa  636  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 
855 aa  648  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 
855 aa  648  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  42.74 
 
 
863 aa  641  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  43.57 
 
 
872 aa  701  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  43.84 
 
 
875 aa  697  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  43.82 
 
 
878 aa  704  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  43.97 
 
 
863 aa  721  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  61.06 
 
 
872 aa  1087  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 
871 aa  684  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  48.06 
 
 
869 aa  795  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  3.95311e-05 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  45.13 
 
 
882 aa  638  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 
853 aa  639  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  48.82 
 
 
823 aa  750  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 
928 aa  668  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  49.08 
 
 
881 aa  816  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  43.09 
 
 
859 aa  689  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 
857 aa  681  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 
872 aa  710  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  75.11 
 
 
872 aa  1335  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  42.07 
 
 
862 aa  655  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
858 aa  678  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
855 aa  712  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 
856 aa  690  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 
853 aa  642  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  48.51 
 
 
868 aa  819  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
855 aa  674  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 
939 aa  655  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 
939 aa  654  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 
891 aa  645  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  40.76 
 
 
881 aa  689  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 
872 aa  710  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  42.56 
 
 
851 aa  664  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  41.6 
 
 
859 aa  661  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  4.08163e-09 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 
860 aa  643  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 
853 aa  642  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 
853 aa  654  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  42.69 
 
 
871 aa  675  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  41.73 
 
 
851 aa  644  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  50.4 
 
 
882 aa  755  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 
895 aa  697  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  45.53 
 
 
864 aa  743  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
856 aa  688  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.75 
 
 
855 aa  680  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 
883 aa  664  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  5.82755e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 
856 aa  684  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.41 
 
 
854 aa  671  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  44.17 
 
 
903 aa  725  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  48.17 
 
 
865 aa  732  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  44.84 
 
 
896 aa  720  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  49.75 
 
 
897 aa  761  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  41.14 
 
 
918 aa  644  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  43.94 
 
 
872 aa  671  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  39.09 
 
 
868 aa  650  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 
860 aa  704  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  44.24 
 
 
888 aa  694  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  43.66 
 
 
865 aa  641  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  45.17 
 
 
868 aa  738  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 
858 aa  723  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
869 aa  1777  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  43.65 
 
 
854 aa  671  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  48.24 
 
 
880 aa  768  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  42.58 
 
 
869 aa  700  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 
894 aa  649  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  46.36 
 
 
891 aa  763  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 
828 aa  664  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 
917 aa  651  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 
893 aa  659  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  44.62 
 
 
886 aa  724  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  44.11 
 
 
858 aa  709  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  45.02 
 
 
862 aa  706  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  46.4 
 
 
868 aa  742  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  40.61 
 
 
848 aa  673  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  49.83 
 
 
898 aa  765  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 
853 aa  655  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  43.19 
 
 
854 aa  666  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  42.97 
 
 
852 aa  663  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  42.33 
 
 
853 aa  642  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  44.52 
 
 
910 aa  697  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
885 aa  687  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  44.36 
 
 
888 aa  696  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 
890 aa  687  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
856 aa  685  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  8.30859e-12 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  45.59 
 
 
853 aa  721  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 
892 aa  685  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>