More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1647 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  100 
 
 		 422 aa  863    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  67.57 
 
 		 428 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  46.1 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  45.18 
 
 		 418 aa  347  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  53.75 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  55.45 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  58.63 
 
 		 418 aa  334  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  63.28 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  47.24 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  46.21 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  61.99 
 
 		 411 aa  326  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  60.45 
 
 		 420 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  56.89 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  43.85 
 
 		 431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  42.25 
 
 		 418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  57.69 
 
 		 369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  49.42 
 
 		 419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 428 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  42.45 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  41.8 
 
 		 418 aa  311  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.62 
 
 		 417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  47.37 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  49.55 
 
 		 420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  54.55 
 
 		 435 aa  306  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  45.5 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  47.3 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  46.97 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  63.04 
 
 		 420 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  51.96 
 
 		 433 aa  298  8e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  51.28 
 
 		 439 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  50.89 
 
 		 421 aa  295  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  55.68 
 
 		 422 aa  293  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  58.62 
 
 		 422 aa  292  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  45.38 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  42.18 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  42.43 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  42.14 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  48.33 
 
 		 474 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  48 
 
 		 474 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  53.51 
 
 		 395 aa  275  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  40 
 
 		 422 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  40.36 
 
 		 407 aa  262  8e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  39.66 
 
 		 409 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  37.89 
 
 		 408 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  37.67 
 
 		 870 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  41.52 
 
 		 424 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  48.01 
 
 		 443 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  40 
 
 		 429 aa  249  9e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  39.39 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  46.13 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  48.03 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  54.85 
 
 		 247 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  38.42 
 
 		 456 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  46.12 
 
 		 423 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  48.58 
 
 		 256 aa  239  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  42.72 
 
 		 464 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  47.97 
 
 		 245 aa  236  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  53.17 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  38.14 
 
 		 424 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.84 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  52.71 
 
 		 411 aa  236  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  53.85 
 
 		 432 aa  236  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  48.18 
 
 		 241 aa  236  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  47.77 
 
 		 241 aa  235  9e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  52.22 
 
 		 262 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  52.68 
 
 		 649 aa  233  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  53.88 
 
 		 250 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  52.51 
 
 		 816 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  39.82 
 
 		 435 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  54.73 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  44.92 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  41.5 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  33.59 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  47.64 
 
 		 472 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  48.77 
 
 		 488 aa  229  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  37.53 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  47.28 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  47.52 
 
 		 493 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  39.26 
 
 		 400 aa  227  4e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  45.49 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  50.45 
 
 		 254 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  40.58 
 
 		 472 aa  225  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  32.16 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  36.14 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  37.47 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  47.37 
 
 		 711 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  43.56 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  44.28 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  37.25 
 
 		 402 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  51.18 
 
 		 420 aa  223  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  35.95 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 		 469 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  35.13 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 		 471 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>