More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3708 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 298 aa  592  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  84.18 
 
 		 298 aa  494  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1217  ATP synthase F1, gamma subunit  60.54 
 
 		 304 aa  352  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.17 
 
 		 309 aa  345  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  56.68 
 
 		 311 aa  344  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0652  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.53 
 
 		 300 aa  344  1e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1269  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.94 
 
 		 302 aa  343  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  58.53 
 
 		 299 aa  334  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  56.63 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.54 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  58.11 
 
 		 303 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  56.7 
 
 		 326 aa  332  4e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10020  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  55.56 
 
 		 298 aa  329  4e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2606  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.48 
 
 		 297 aa  326  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00110319  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  54.22 
 
 		 306 aa  326  4.0000000000000003e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  56.71 
 
 		 298 aa  325  6e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11336  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.26 
 
 		 305 aa  323  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2339  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.78 
 
 		 296 aa  321  8e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1670  ATP synthase  56.75 
 
 		 299 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  58.48 
 
 		 300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6137  ATP synthase F1, gamma subunit  56.17 
 
 		 312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3863  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.1 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435171  normal  0.0127444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3877  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.1 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.1 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  hitchhiker  0.00852042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  53.09 
 
 		 310 aa  315  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0335  ATP synthase F1, gamma subunit  55.97 
 
 		 306 aa  310  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.06 
 
 		 297 aa  308  6.999999999999999e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2408  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  57.04 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3917  ATP synthase F1, gamma subunit  53.51 
 
 		 300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.858862  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1306  ATP synthase F1, gamma subunit  54.39 
 
 		 297 aa  301  7.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2317  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.56 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4329  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.88 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48174  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2125  ATP synthase F1, gamma subunit  53.64 
 
 		 308 aa  291  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000311556  normal  0.0143953 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2449  ATP synthase F1, gamma subunit  53.56 
 
 		 298 aa  286  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1315  ATP synthase F1 subunit gamma  51.95 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  48.67 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19140  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  47.65 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1124  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.91 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.05 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.71 
 
 		 288 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.71 
 
 		 288 aa  235  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.84 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 286 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0147  ATP synthase F1, gamma subunit  37.88 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.64 
 
 		 285 aa  221  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  44.37 
 
 		 287 aa  221  9e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.14 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.37 
 
 		 286 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.71 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  43.39 
 
 		 285 aa  219  6e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.92 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.03 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.03 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.49 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  42.48 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.69 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.57 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  42.57 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  39.66 
 
 		 287 aa  212  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.12 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.69 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 		 287 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.92 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3285  ATP synthase F1, gamma subunit  40.61 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  42.46 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.29 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.72 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.72 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.18 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  42.46 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.29 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.14 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.14 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  39.72 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  40.69 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  39.72 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.68 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  39.66 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.59 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.11 
 
 		 289 aa  201  9e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.24 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.53 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>