More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0446 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0446  sucrose-phosphate synthase  100 
 
 
479 aa  973    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  53.14 
 
 
472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  48.19 
 
 
496 aa  425  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  50.79 
 
 
423 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  34.48 
 
 
735 aa  240  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  32.19 
 
 
708 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  31.38 
 
 
702 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  35.43 
 
 
470 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  33.33 
 
 
721 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  31.49 
 
 
707 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  37.41 
 
 
469 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  33.62 
 
 
716 aa  226  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  33.49 
 
 
722 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  32.18 
 
 
718 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  33.04 
 
 
784 aa  224  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  36.36 
 
 
469 aa  223  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  33.48 
 
 
720 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  34.37 
 
 
469 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  30.09 
 
 
707 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  31.07 
 
 
709 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  32.89 
 
 
466 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
709 aa  217  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  33.56 
 
 
723 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  32.39 
 
 
725 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  32.75 
 
 
724 aa  210  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  32.24 
 
 
729 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  31.4 
 
 
714 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  31.4 
 
 
714 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  27.82 
 
 
806 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.44 
 
 
762 aa  159  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  25.2 
 
 
792 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  27.07 
 
 
795 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  26.36 
 
 
794 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  27.49 
 
 
805 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
806 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
448 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  25.11 
 
 
793 aa  134  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  25.11 
 
 
814 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  28.31 
 
 
684 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.94 
 
 
684 aa  131  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
805 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.41 
 
 
688 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  27.48 
 
 
420 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
423 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
426 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3916  Sucrose synthase  25 
 
 
803 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.067328 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0215  sucrose synthase  25 
 
 
809 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
421 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
405 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
422 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
419 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  25.24 
 
 
424 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  25.05 
 
 
421 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
419 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  23.15 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
434 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  22.41 
 
 
439 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  22.41 
 
 
439 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  22.41 
 
 
439 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
435 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
672 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  25.32 
 
 
417 aa  97.1  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
448 aa  96.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  25.74 
 
 
443 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  21.7 
 
 
438 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  21.7 
 
 
438 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
422 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  24.23 
 
 
423 aa  95.5  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
477 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 
438 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  24.58 
 
 
427 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
420 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
424 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 
405 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
458 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  24.55 
 
 
417 aa  91.3  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  23.91 
 
 
413 aa  90.1  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  24.4 
 
 
650 aa  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  24.54 
 
 
434 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  22.17 
 
 
458 aa  88.2  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  23.04 
 
 
439 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  23.1 
 
 
442 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
434 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  23.72 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  24.59 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  23.45 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  24 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  23.83 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.88 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  23.91 
 
 
397 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>