51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3008 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1177    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  37.93 
 
 		 562 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  35.94 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  30.84 
 
 		 712 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  26.85 
 
 		 619 aa  79.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  29.17 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  30.6 
 
 		 588 aa  58.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  32.24 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  38.71 
 
 		 532 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  45 
 
 		 439 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.79 
 
 		 652 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  25.96 
 
 		 464 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  34.21 
 
 		 422 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  36.36 
 
 		 577 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  30.85 
 
 		 457 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  26.4 
 
 		 449 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  29.7 
 
 		 454 aa  50.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  33.33 
 
 		 410 aa  50.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.51 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  30.85 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  30.69 
 
 		 455 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  36.67 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  27.32 
 
 		 452 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.51 
 
 		 607 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 452 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  21.94 
 
 		 506 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  29.32 
 
 		 515 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  27.73 
 
 		 410 aa  48.5  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  38.98 
 
 		 423 aa  48.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  40.68 
 
 		 422 aa  48.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  39.51 
 
 		 446 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  31.4 
 
 		 403 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  29.33 
 
 		 421 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  32.86 
 
 		 408 aa  47.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  30 
 
 		 406 aa  47.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  40.74 
 
 		 443 aa  47.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  27.87 
 
 		 453 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  21.43 
 
 		 519 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  27.61 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  38.27 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  25.21 
 
 		 736 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  29 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  37.29 
 
 		 420 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  45.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  26.05 
 
 		 509 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  25.45 
 
 		 251 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  30.17 
 
 		 505 aa  44.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  40 
 
 		 478 aa  44.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  30 
 
 		 458 aa  43.5  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  28.85 
 
 		 666 aa  43.5  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  32.53 
 
 		 336 aa  43.5  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>