More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2235 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  58 
 
 		 209 aa  225  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  49.23 
 
 		 203 aa  207  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  51.53 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  44.39 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  39.11 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  43.72 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  41.67 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  39.69 
 
 		 222 aa  158  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  38.58 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  42 
 
 		 211 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  40.82 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  42.35 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  40.31 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  39.69 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  39.69 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  38.58 
 
 		 213 aa  151  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  38.58 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  38.58 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  36.55 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  36.55 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  37.24 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  38.66 
 
 		 222 aa  147  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  39.49 
 
 		 213 aa  147  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  37.24 
 
 		 203 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  37.24 
 
 		 203 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  42.16 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  39 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  37.06 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  37.06 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  37.06 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  42.16 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  40.7 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  37.06 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  40.2 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  37.44 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  42.5 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  37.13 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  38.12 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  42 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  38.19 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  38.69 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  36.22 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  40.69 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  40 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  36.73 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  39.81 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  39.3 
 
 		 220 aa  141  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  35.53 
 
 		 202 aa  141  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  38 
 
 		 208 aa  140  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  35.86 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  36.36 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  36.79 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  38.69 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  38.69 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  38.69 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  44.72 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  38.69 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  35.03 
 
 		 202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  35.03 
 
 		 202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  35.03 
 
 		 202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  35.03 
 
 		 202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  35.03 
 
 		 202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0721  hypothetical protein  38.81 
 
 		 220 aa  137  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  34.52 
 
 		 202 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  36.46 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_002950  PG0587  yadS protein  40.32 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  40.51 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  37.19 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  38.19 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  36.41 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  40.1 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  38.58 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000736449  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  37.5 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  36.87 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  41.99 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3955  inner membrane protein YicG  38.07 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4064  hypothetical protein  38.07 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  38 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3946  inner membrane protein YicG  38.07 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4125  inner membrane protein YicG  38.07 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4018  inner membrane protein YicG  38.07 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  36.68 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  36.18 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  38 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  34.67 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  38.22 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  37.89 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03503  conserved inner membrane protein  36.93 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  36.93 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  38.54 
 
 		 205 aa  131  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0065  hypothetical protein  36.93 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0883885  hitchhiker  0.000264981 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  36.93 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4149  hypothetical protein  36.93 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.375876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  36.93 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1246  hypothetical protein  38.07 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0111602  normal  0.59832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03455  hypothetical protein  36.93 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  36.93 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  36.93 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  37 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>