More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1327 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1327  serine dehydratase alpha chain  100 
 
 		 410 aa  855    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016553 
 
 
-
 
NC_002950  PG0084  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  54.18 
 
 		 399 aa  424  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3111  L-serine ammonia-lyase  51.5 
 
 		 404 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0917  serine dehydratase alpha chain  52.62 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3034  L-serine ammonia-lyase  51.63 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2070  serine dehydratase alpha chain  48.72 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3112  serine dehydratase alpha chain  48.64 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0667312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  43.69 
 
 		 457 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  40.99 
 
 		 475 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  41.33 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  41.57 
 
 		 469 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  42.67 
 
 		 462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  41.35 
 
 		 458 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  41.02 
 
 		 459 aa  308  8e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  42.44 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0687  L-serine dehydratase 1  41.91 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  40 
 
 		 468 aa  306  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  42.25 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  40.18 
 
 		 460 aa  305  8.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  41.39 
 
 		 450 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  41.8 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2451  L-serine dehydratase 1  42.27 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2355  L-serine ammonia-lyase  42.27 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1638  L-serine dehydratase  42.05 
 
 		 454 aa  302  6.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  41.24 
 
 		 464 aa  302  9e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2383  L-serine ammonia-lyase  41.67 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  40.4 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0518  L-serine dehydratase 1  41.57 
 
 		 457 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0654  L-serine dehydratase 1  41.39 
 
 		 462 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344045  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2667  L-serine dehydratase 1  40.76 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  40.71 
 
 		 458 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  40.58 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  43.08 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  43.08 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  43.08 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  43.08 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  43.08 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  43.08 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  43.08 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  43.08 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  43.08 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  40.93 
 
 		 463 aa  299  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  40.53 
 
 		 458 aa  299  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1966  L-serine ammonia-lyase  42.42 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2027  L-serine ammonia-lyase  42.42 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1305  L-serine ammonia-lyase  42.42 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0226237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1970  L-serine ammonia-lyase  42.42 
 
 		 454 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  41.43 
 
 		 453 aa  298  8e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1490  L-serine ammonia-lyase  42.42 
 
 		 454 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0288  L-serine ammonia-lyase  40.94 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1902  L-serine dehydratase  40.94 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.457679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0116  L-serine dehydratase 1  41.39 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117006  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  40 
 
 		 458 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1985  L-serine dehydratase 1  42.2 
 
 		 453 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  40.7 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1241  L-serine dehydratase 1  41.2 
 
 		 456 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.341866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1928  L-serine dehydratase 1  41.67 
 
 		 454 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2223  L-serine dehydratase 1  41.45 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  40.72 
 
 		 455 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01908  L-serine dehydratase 1  40.98 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  40.53 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  41.52 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  39.96 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  41.02 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  39.33 
 
 		 458 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  39.48 
 
 		 472 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  39.33 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  38.77 
 
 		 499 aa  292  6e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  39.52 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1343  L-serine dehydratase 1  40.67 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0082  L-serine ammonia-lyase  40.53 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1195  L-serine dehydratase 1  40.3 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  40.18 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2810  L-serine dehydratase 1  41.11 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1196  L-serine ammonia-lyase  40.09 
 
 		 477 aa  290  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.741628  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12590  L-serine ammonia-lyase  41.87 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.82368  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2940  L-serine dehydratase 1  40.76 
 
 		 455 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.544189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  41.24 
 
 		 455 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  41.24 
 
 		 455 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  40.18 
 
 		 462 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  40.53 
 
 		 458 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  38.55 
 
 		 458 aa  289  7e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  39.6 
 
 		 454 aa  288  9e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  38.72 
 
 		 456 aa  288  9e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02642  L-serine deaminase II  41.24 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02604  hypothetical protein  41.24 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3038  L-serine ammonia-lyase  40.36 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.883779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003155  L-serine dehydratase  39.87 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.225865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2937  L-serine ammonia-lyase 2  40.8 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.427341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3102  L-serine dehydratase 2  41.24 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2941  L-serine ammonia-lyase  41.24 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.73805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0915  L-serine dehydratase 1  41.24 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  40.35 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  38.86 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4061  L-serine ammonia-lyase 2  41.24 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2570  L-serine dehydratase 1  39.42 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2711  L-serine dehydratase 1  40.76 
 
 		 458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  39.73 
 
 		 460 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  39.04 
 
 		 457 aa  286  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2194  L-serine dehydratase 1  40.09 
 
 		 452 aa  286  5.999999999999999e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>