More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12590  L-serine ammonia-lyase  100 
 
 		 464 aa  931    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.82368  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  60 
 
 		 455 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  57.52 
 
 		 458 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  59.05 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  58.55 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  56.77 
 
 		 457 aa  498  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  59.69 
 
 		 459 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  58.77 
 
 		 457 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  57.54 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2874  L-serine dehydratase 1  59.26 
 
 		 457 aa  494  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.30844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  56.26 
 
 		 463 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  56.47 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  55.83 
 
 		 475 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  57.76 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  57.33 
 
 		 458 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  56.9 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  56.9 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  57.42 
 
 		 460 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  57.7 
 
 		 458 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  55.49 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  58.89 
 
 		 473 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0518  L-serine dehydratase 1  58.46 
 
 		 465 aa  478  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166535  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0430  L-serine dehydratase 1  58.24 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  55 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  54.09 
 
 		 475 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  53.31 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  55.19 
 
 		 468 aa  478  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0061  L-serine dehydratase 1  57.38 
 
 		 475 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0768  L-serine ammonia-lyase  57.38 
 
 		 475 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  57.39 
 
 		 458 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  56.49 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10069  L-serine dehydratase sdaA  56.65 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0883  L-serine dehydratase 1  57.02 
 
 		 485 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  54.11 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  55.9 
 
 		 457 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18870  L-serine ammonia-lyase  58.95 
 
 		 457 aa  472  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0534  L-serine dehydratase 1  57.02 
 
 		 485 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  56.49 
 
 		 462 aa  471  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3620  L-serine dehydratase 1  55.24 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.294532  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3296  L-serine dehydratase  56.52 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3164  L-serine dehydratase 1  56.96 
 
 		 458 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5237  L-serine ammonia-lyase  56.3 
 
 		 458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0233321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  54.31 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0322  L-serine dehydratase 1  55.46 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  54.59 
 
 		 458 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  56.52 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  56.46 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3280  L-serine dehydratase 1  53.8 
 
 		 460 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4911  L-serine dehydratase 1  55.03 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0297  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  55.65 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  54.86 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  53.71 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  55.65 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  55.29 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  53.45 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  53.18 
 
 		 458 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5070  L-serine dehydratase 1  55.08 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  54.37 
 
 		 458 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  54.37 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4547  L-serine dehydratase 1  55.08 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  54.37 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2570  L-serine dehydratase 1  53.81 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  57.92 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0317  L-serine dehydratase 1  55.87 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2711  L-serine dehydratase 1  53.6 
 
 		 458 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  53.6 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6165  L-serine dehydratase  55.03 
 
 		 485 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  54.06 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  54.64 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5127  L-serine dehydratase 1  55.08 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  51.89 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  53.66 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3215  L-serine dehydratase 1  55.08 
 
 		 529 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  54.37 
 
 		 458 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1473  L-serine ammonia-lyase  55.91 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0162786  normal  0.053495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1304  L-serine dehydratase 1  54.32 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039374  normal  0.309635 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5152  L-serine dehydratase 1  55.08 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1955  L-serine ammonia-lyase  54.21 
 
 		 504 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1863  L-serine ammonia-lyase  54.21 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0396  L-serine ammonia-lyase  54.21 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0920  L-serine ammonia-lyase  54.13 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  54.37 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  53.48 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2524  L-serine dehydratase 1  53.28 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.418304  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3522  Iron-sulfur-dependent L-serine dehydratase single chain form  53.75 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4831  L-serine ammonia-lyase  53.21 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2406  L-serine dehydratase 1  53.28 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0995  L-serine ammonia-lyase  53.56 
 
 		 490 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1942  L-serine dehydratase 1  53.28 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0383387  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  53.28 
 
 		 457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0819  L-serine dehydratase 1  56.71 
 
 		 452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101463  normal  0.657436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71060  L-serine dehydratase  55.25 
 
 		 458 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5047  L-serine dehydratase 1  53.65 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.533739  normal  0.269496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2417  L-serine dehydratase 1  53.28 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  51.63 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1886  L-serine dehydratase 1  53.53 
 
 		 458 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732731  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0213  L-serine dehydratase 1  53.57 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3321  L-serine ammonia-lyase  54.31 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1601  L-serine ammonia-lyase  52.58 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  53.26 
 
 		 458 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>