More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0061 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0534  L-serine dehydratase 1  84.95 
 
 
485 aa  799    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0061  L-serine dehydratase 1  100 
 
 
475 aa  959    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0768  L-serine ammonia-lyase  100 
 
 
475 aa  959    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0883  L-serine dehydratase 1  84.95 
 
 
485 aa  799    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  61.34 
 
 
455 aa  535  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10069  L-serine dehydratase sdaA  60.96 
 
 
461 aa  538  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.203084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  62.11 
 
 
473 aa  529  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  60.5 
 
 
460 aa  531  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  58.91 
 
 
458 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  58.53 
 
 
457 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  58.42 
 
 
458 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  58.11 
 
 
458 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  59.28 
 
 
457 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3620  L-serine dehydratase 1  58.23 
 
 
467 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.294532  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  58.7 
 
 
458 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  58.4 
 
 
458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  58.54 
 
 
469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  57.38 
 
 
458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  57.98 
 
 
458 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  57.98 
 
 
458 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  56.5 
 
 
475 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02760  L-serine ammonia-lyase  57.56 
 
 
472 aa  506  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  58.32 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  58.28 
 
 
462 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0213  L-serine dehydratase 1  57.02 
 
 
462 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  57.89 
 
 
458 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  58.28 
 
 
462 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12590  L-serine ammonia-lyase  57.38 
 
 
464 aa  498  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.82368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  56.76 
 
 
464 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  55.6 
 
 
462 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  56.28 
 
 
460 aa  501  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  56.22 
 
 
462 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1304  L-serine dehydratase 1  55.73 
 
 
476 aa  501  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039374  normal  0.309635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  59.12 
 
 
458 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  55.19 
 
 
462 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2570  L-serine dehydratase 1  57.26 
 
 
458 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  57.2 
 
 
463 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  57.68 
 
 
458 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3296  L-serine dehydratase  57.89 
 
 
458 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  56.49 
 
 
470 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  55.05 
 
 
472 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6165  L-serine dehydratase  58.32 
 
 
485 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  56.24 
 
 
475 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2711  L-serine dehydratase 1  57.47 
 
 
458 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.468733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3164  L-serine dehydratase 1  57.68 
 
 
458 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3280  L-serine dehydratase 1  57.08 
 
 
460 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  56.07 
 
 
468 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71060  L-serine dehydratase  58.19 
 
 
458 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  56.58 
 
 
463 aa  491  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  54.93 
 
 
459 aa  485  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  57.47 
 
 
458 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  56.3 
 
 
458 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2874  L-serine dehydratase 1  56.51 
 
 
457 aa  488  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.30844  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  52.94 
 
 
458 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  52.73 
 
 
458 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  56.93 
 
 
458 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3251  L-serine ammonia-lyase  55.6 
 
 
462 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  55.35 
 
 
462 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1886  L-serine dehydratase 1  56 
 
 
458 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4002  L-serine ammonia-lyase  55.19 
 
 
462 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2991  L-serine ammonia-lyase  55.19 
 
 
462 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0131  L-serine ammonia-lyase  55.39 
 
 
462 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3056  L-serine ammonia-lyase  55.19 
 
 
462 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.541658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0322  L-serine dehydratase 1  56.84 
 
 
458 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0518  L-serine dehydratase 1  57.29 
 
 
465 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166535  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3314  L-serine ammonia-lyase  55.19 
 
 
462 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544154  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0317  L-serine dehydratase 1  56.63 
 
 
458 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1546  L-serine ammonia-lyase  55.19 
 
 
462 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3931  L-serine ammonia-lyase  55.39 
 
 
462 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.706313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0155  L-serine dehydratase 1  55.19 
 
 
462 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0297  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  56.42 
 
 
458 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4911  L-serine dehydratase 1  56.42 
 
 
458 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049698 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  55.3 
 
 
461 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  55.51 
 
 
462 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0141  L-serine dehydratase 1  55 
 
 
462 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3522  Iron-sulfur-dependent L-serine dehydratase single chain form  55.79 
 
 
458 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540512  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0920  L-serine ammonia-lyase  56.21 
 
 
458 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3321  L-serine ammonia-lyase  54.98 
 
 
462 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0430  L-serine dehydratase 1  57.08 
 
 
465 aa  478  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0982  L-serine ammonia-lyase  56.84 
 
 
459 aa  475  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  55.32 
 
 
461 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2913  L-serine dehydratase 1  55.19 
 
 
462 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  52.94 
 
 
457 aa  477  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0139  L-serine dehydratase 1  54.98 
 
 
462 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0129  L-serine dehydratase 1  55 
 
 
462 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0142  L-serine dehydratase 1  55.19 
 
 
462 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  52.64 
 
 
458 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  52.95 
 
 
457 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4831  L-serine ammonia-lyase  55 
 
 
462 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  55.46 
 
 
461 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0995  L-serine ammonia-lyase  55.53 
 
 
490 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0082  L-serine ammonia-lyase  54.77 
 
 
489 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  52.53 
 
 
458 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5127  L-serine dehydratase 1  55.32 
 
 
461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5047  L-serine dehydratase 1  54.66 
 
 
464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.533739  normal  0.269496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5237  L-serine ammonia-lyase  55.46 
 
 
458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0233321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3215  L-serine dehydratase 1  55.53 
 
 
529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4547  L-serine dehydratase 1  55.25 
 
 
461 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5152  L-serine dehydratase 1  55.32 
 
 
461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  52.32 
 
 
458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.138393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>