More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0987 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0987  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.000000124238  decreased coverage  8.983340000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  36.84 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.43 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  37.9 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  36.29 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  33.87 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  33.87 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  34.96 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  37.9 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.06 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  34.43 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  35.48 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  34.65 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.55 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  36.29 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.4 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  36.29 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.15 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  26.94 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  37.1 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  37.1 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  32 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.06 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  32.52 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  32.26 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.38 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  28.16 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  34.23 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  33.09 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  32.19 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1384  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0425171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  31.91 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.3 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.61 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  33.33 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  33.33 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.61 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  41.38 
 
 		 819 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  32.26 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  32.26 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  32.26 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  32.26 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  32.26 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  25.43 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.33 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  32.26 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  32.26 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  35.48 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  34.15 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.78 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  32.26 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.89 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  33.33 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  35.2 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  33.06 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.15 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_002936  DET1640  LexA repressor  29.23 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0943463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  31.45 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  28.89 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  35.87 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  30.16 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.15 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  30.16 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  30.16 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1522  LexA repressor  29.23 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0737181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.2 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.69 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  32.73 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  30.16 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  30.77 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  32.79 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  25.64 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.16 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  32.26 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  31.45 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  31.45 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.57 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5333  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.36 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.92 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  31.71 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.91 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  32.26 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3234  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.35 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  31.97 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.75 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  33.06 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  31.48 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  31.45 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  30.65 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  33.33 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  34.68 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.98 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  34.96 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  30.95 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  31.71 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2070  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.41 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  34.13 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  29.37 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>