79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0041 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  100 
 
 
394 aa  797  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  100 
 
 
394 aa  797  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  99.13 
 
 
344 aa  694  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  797  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  100 
 
 
394 aa  797  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  99.75 
 
 
394 aa  795  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  100 
 
 
394 aa  797  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  99.49 
 
 
394 aa  794  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  72.26 
 
 
393 aa  567  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.01589e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  71.76 
 
 
393 aa  565  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.81486e-05  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  72.26 
 
 
393 aa  567  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.97031e-05  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  71.76 
 
 
393 aa  564  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.02092e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  71.76 
 
 
393 aa  564  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  1.91341e-05  hitchhiker  2.12529e-05 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  71.76 
 
 
393 aa  564  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  71.76 
 
 
393 aa  564  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  71.76 
 
 
393 aa  564  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.03316e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  71.5 
 
 
393 aa  562  1e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.16753e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  70.23 
 
 
393 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  70.23 
 
 
393 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  70.23 
 
 
393 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  6.30797e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  69.97 
 
 
393 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  1.69528e-07 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  69.97 
 
 
393 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.7927e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  68.61 
 
 
393 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  61.58 
 
 
409 aa  506  1e-142  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  4.46244e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  62.44 
 
 
392 aa  501  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  59.95 
 
 
393 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  61.58 
 
 
392 aa  492  1e-138  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  60.15 
 
 
392 aa  467  1e-130  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  48.59 
 
 
393 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  48.59 
 
 
393 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  48.59 
 
 
393 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  47.16 
 
 
392 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  48.72 
 
 
392 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  47.16 
 
 
392 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  4.16053e-06 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  47.16 
 
 
392 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  47.16 
 
 
392 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  46.91 
 
 
392 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  46.91 
 
 
392 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  52.86 
 
 
399 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  46.91 
 
 
381 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  41.75 
 
 
360 aa  308  1e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  36.12 
 
 
371 aa  207  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  32.36 
 
 
404 aa  201  1e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  32.53 
 
 
402 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 
411 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  31.28 
 
 
359 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  28.39 
 
 
402 aa  142  1e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  29.89 
 
 
415 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  27.13 
 
 
404 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  27.13 
 
 
404 aa  134  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 
444 aa  131  2e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  29.84 
 
 
456 aa  131  2e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  24.55 
 
 
405 aa  120  5e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  30.42 
 
 
431 aa  119  1e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  30.42 
 
 
431 aa  119  1e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  28.95 
 
 
433 aa  115  1e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  30.25 
 
 
431 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  28.27 
 
 
431 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  24.86 
 
 
392 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  24.53 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
388 aa  83.2  7e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  37.4 
 
 
160 aa  77  5e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  9.59225e-05 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
399 aa  75.9  1e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  28.9 
 
 
392 aa  74.7  2e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  20.79 
 
 
397 aa  73.2  7e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  25.2 
 
 
415 aa  72  2e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
407 aa  68.9  1e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 
403 aa  59.3  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  22.52 
 
 
402 aa  54.7  3e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 
403 aa  53.9  5e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  26.55 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  23.79 
 
 
440 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  22.22 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.21 
 
 
399 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  28.37 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  28.36 
 
 
492 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  22.56 
 
 
391 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 
388 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>