More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0136 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 
864 aa  952    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  87.61 
 
 
802 aa  1464    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 
808 aa  1679    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
881 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  37.83 
 
 
846 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  38.33 
 
 
925 aa  596  1e-169  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  38.9 
 
 
836 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  38.77 
 
 
858 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
911 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
906 aa  582  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  36.04 
 
 
886 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
908 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
896 aa  578  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
894 aa  576  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
855 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
876 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
901 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
860 aa  566  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  36.73 
 
 
861 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
905 aa  568  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 
902 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
873 aa  568  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
845 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
862 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
928 aa  560  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  36 
 
 
877 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
892 aa  557  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  36.77 
 
 
916 aa  557  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
885 aa  548  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
871 aa  547  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
903 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
872 aa  545  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 
895 aa  538  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
886 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
886 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
886 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
886 aa  512  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  36 
 
 
865 aa  511  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
865 aa  504  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
864 aa  504  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
906 aa  499  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
855 aa  497  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
869 aa  489  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
877 aa  489  1e-137  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
865 aa  490  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
863 aa  487  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
809 aa  487  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
863 aa  484  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
858 aa  478  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
799 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
799 aa  443  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
799 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
799 aa  436  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 
816 aa  423  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
808 aa  422  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 
806 aa  414  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 
771 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 
880 aa  366  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 
881 aa  363  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 
881 aa  363  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 
881 aa  363  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 
881 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 
881 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 
881 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 
881 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 
881 aa  360  6e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 
881 aa  359  9e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 
880 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 
881 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
881 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 
876 aa  349  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 
879 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 
884 aa  343  8e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 
876 aa  343  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 
876 aa  343  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 
894 aa  336  7.999999999999999e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 
879 aa  335  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 
865 aa  332  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
880 aa  332  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 
865 aa  332  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 
909 aa  330  9e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl355  valyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 
873 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.473625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2239  valyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 
868 aa  329  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659246  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 
909 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 
883 aa  328  3e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 
883 aa  327  8.000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
909 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 
880 aa  326  1e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 
880 aa  325  2e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 
882 aa  324  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 
880 aa  323  6e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 
867 aa  322  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 
879 aa  322  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
909 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 
1006 aa  321  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 
892 aa  320  6e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 
880 aa  320  7.999999999999999e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 
884 aa  319  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
947 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
902 aa  319  2e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>