More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2121 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2121  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
372 aa  757    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.430294  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2910  glycosyl transferase group 1  62.5 
 
 
418 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.168216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1118  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.55 
 
 
392 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.357165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.9 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
406 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  32.53 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
996 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
401 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
446 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
408 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
411 aa  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
476 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
433 aa  63.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
390 aa  62.8  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.51 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
345 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
406 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2554  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.51 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5244  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 
318 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0391994 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.84 
 
 
407 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
399 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
394 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
382 aa  60.1  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  36.23 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
376 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
378 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.18 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  24.18 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  24.18 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  24.18 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  26.42 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  30.36 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
748 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
765 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.18 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.77 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3347  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
377 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.18 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
369 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
821 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 
519 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
396 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.6 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  22.08 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
414 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  20.05 
 
 
373 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 
377 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.13 
 
 
381 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
669 aa  56.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.8 
 
 
384 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 
430 aa  56.2  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
393 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
381 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
821 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
821 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
821 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4807  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.2 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.08 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
410 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119517  glycosyl transferase, putative alpha-1,3-mannosyltransferase  26.8 
 
 
480 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  22.69 
 
 
350 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  26.53 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
413 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.42 
 
 
348 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  23 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  24.79 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3105  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>