More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1506 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  79.25 
 
 		 241 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  73.75 
 
 		 240 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  66.95 
 
 		 242 aa  330  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  64.58 
 
 		 240 aa  322  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  59.07 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  57.38 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  53.53 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  54.58 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  55.19 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  55.08 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  55.04 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  56.72 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  54.62 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  54.81 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  54.55 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  53.11 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  56.72 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  52.28 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  56.3 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  54.77 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  56.6 
 
 		 262 aa  274  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  54.01 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  52.77 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  57.39 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  54.36 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  53.11 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  54.43 
 
 		 243 aa  271  6e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  271  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  52.28 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 		 241 aa  271  7e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  51.45 
 
 		 241 aa  271  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  55.14 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  54.74 
 
 		 316 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  54.36 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  54.36 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  55 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  55.32 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  55.32 
 
 		 266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  55.32 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  55.32 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  54.35 
 
 		 263 aa  268  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.6 
 
 		 241 aa  268  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  51.45 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  55.83 
 
 		 264 aa  268  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.6 
 
 		 241 aa  268  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  53.16 
 
 		 254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  54.31 
 
 		 271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  51.87 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  268  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  52.74 
 
 		 249 aa  268  8e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  56.54 
 
 		 247 aa  268  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 		 246 aa  267  8.999999999999999e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.19 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  54.78 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  50.62 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  52.52 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  52.17 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  52.3 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  52.3 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  54.77 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  55.7 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  53.94 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  54.2 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  53.45 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 277 aa  265  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  53.94 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  51.88 
 
 		 265 aa  265  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  52.32 
 
 		 245 aa  265  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  51.87 
 
 		 244 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  53.59 
 
 		 259 aa  264  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  53.16 
 
 		 268 aa  264  8.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  54.81 
 
 		 290 aa  263  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1152  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.09 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  54.81 
 
 		 289 aa  263  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  51.87 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  53.45 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  55.19 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  53.91 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  52.28 
 
 		 259 aa  263  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0506  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.09 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.503338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0442  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.09 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  53.33 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  52.7 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  54.74 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.87 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  50.63 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>