More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1268 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
388 aa  751  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  61.44 
 
 
383 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  57.81 
 
 
386 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
391 aa  339  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.91868e-06  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  36.24 
 
 
405 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 
400 aa  176  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
415 aa  141  2e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
411 aa  135  2e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
385 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  29.94 
 
 
393 aa  118  2e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  27.83 
 
 
384 aa  118  2e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  29.94 
 
 
393 aa  118  2e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  27.75 
 
 
393 aa  115  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
399 aa  115  2e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  27.91 
 
 
392 aa  114  2e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  27.75 
 
 
393 aa  114  2e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
404 aa  114  4e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  27.75 
 
 
393 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
396 aa  111  2e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  26.91 
 
 
393 aa  110  4e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  27.09 
 
 
394 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  26.8 
 
 
394 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
439 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  26.34 
 
 
474 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
420 aa  106  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  26.18 
 
 
406 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  28.45 
 
 
393 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  27.96 
 
 
393 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  28.36 
 
 
402 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  33.04 
 
 
396 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
400 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
407 aa  99.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  29.89 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.65 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  25.29 
 
 
404 aa  96.7  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  31.72 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  29.18 
 
 
373 aa  90.5  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.6 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1077  major facilitator transporter  27.76 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.99 
 
 
466 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  35.08 
 
 
582 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  36.36 
 
 
409 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
392 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.24014e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  36.16 
 
 
553 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  24.38 
 
 
444 aa  85.9  1e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
390 aa  85.5  1e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.42544e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  21.7 
 
 
387 aa  85.9  1e-15  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.12 
 
 
400 aa  85.5  2e-15  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.71 
 
 
394 aa  85.1  2e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  27.35 
 
 
409 aa  84.7  3e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  27.69 
 
 
387 aa  83.6  6e-15  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
388 aa  83.2  6e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  26.49 
 
 
414 aa  83.2  7e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  26.06 
 
 
397 aa  83.2  8e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  1.14311e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  24.79 
 
 
397 aa  82.8  1e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25.51 
 
 
387 aa  82.8  1e-14  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 
485 aa  82.4  1e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  29.47 
 
 
422 aa  81.6  2e-14  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.5 
 
 
409 aa  81.6  2e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.91 
 
 
458 aa  81.6  2e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  33.54 
 
 
421 aa  82  2e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  33.15 
 
 
469 aa  81.3  3e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  23.73 
 
 
417 aa  80.9  3e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.93 
 
 
391 aa  81.3  3e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.94 
 
 
401 aa  80.9  3e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.16 
 
 
412 aa  80.9  4e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  23.38 
 
 
432 aa  80.9  4e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  36.93 
 
 
409 aa  80.5  4e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.86 
 
 
587 aa  80.9  4e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  23.38 
 
 
432 aa  80.9  4e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20 
 
 
388 aa  80.5  4e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
398 aa  80.9  4e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20 
 
 
388 aa  80.5  4e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  22.55 
 
 
423 aa  80.5  5e-14  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  28.99 
 
 
421 aa  80.5  5e-14  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.52 
 
 
410 aa  79.7  7e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  24.09 
 
 
409 aa  80.1  7e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7408e-14 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  29.71 
 
 
403 aa  79.7  7e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.39 
 
 
476 aa  79  1e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.56155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  35.75 
 
 
409 aa  79  1e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  35.75 
 
 
409 aa  79  1e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  22.55 
 
 
423 aa  79.3  1e-13  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  25.54 
 
 
399 aa  79  1e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  35.75 
 
 
409 aa  79  1e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1787  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  25.54 
 
 
399 aa  79  1e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3235  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.3 
 
 
399 aa  79.3  1e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.54906e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 
411 aa  78.6  2e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  37.68 
 
 
444 aa  78.2  2e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
425 aa  78.2  2e-13  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
414 aa  78.2  2e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  24.88 
 
 
452 aa  78.6  2e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.08 
 
 
424 aa  78.6  2e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.78 
 
 
408 aa  78.6  2e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.42 
 
 
395 aa  78.2  2e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  23.58 
 
 
432 aa  78.6  2e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 
523 aa  78.2  2e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  25.85 
 
 
399 aa  77.8  3e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>