More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0730 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0730  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
351 aa  723    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0424443  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0966  metal dependent phosphohydrolase  76.88 
 
 
343 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1102  metal dependent phosphohydrolase  64.09 
 
 
347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1031  metal dependent phosphohydrolase  69.28 
 
 
342 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1227  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 
394 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0012  hypothetical protein  28.47 
 
 
332 aa  102  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000839505  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 
349 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  41.09 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4913  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  39.1 
 
 
453 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4449  metal-dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.508967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4963  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102256  normal  0.0892849 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  36.81 
 
 
462 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  37.91 
 
 
405 aa  94  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2662  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  45.05 
 
 
1073 aa  93.6  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  32.93 
 
 
419 aa  93.2  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 
416 aa  93.2  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  30.21 
 
 
395 aa  93.2  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  38.19 
 
 
364 aa  92.8  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  32.73 
 
 
401 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  32.37 
 
 
362 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  31.89 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3572  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
516 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  29.74 
 
 
410 aa  90.9  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 
412 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 
328 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  38.13 
 
 
565 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 
328 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  32.72 
 
 
550 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  38.19 
 
 
401 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  30.26 
 
 
421 aa  89.4  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  30.91 
 
 
431 aa  89.4  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 
419 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
419 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 
483 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  36.64 
 
 
615 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 
545 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 
356 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  36.23 
 
 
352 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  37.67 
 
 
619 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 
401 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  38.35 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 
451 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 
814 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.16 
 
 
492 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 
495 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  29.76 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  42.72 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  42.72 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  42.72 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  42.72 
 
 
374 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  34.93 
 
 
481 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  42.72 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.4 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
451 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  34.25 
 
 
384 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  34.67 
 
 
334 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  30.14 
 
 
436 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1939  GAF domain/His kinase A domain/HD domain-containing protein  35.06 
 
 
787 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
617 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 
618 aa  87  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  34.07 
 
 
404 aa  86.7  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 
402 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  43.81 
 
 
371 aa  86.7  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  41.35 
 
 
771 aa  86.3  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 
403 aa  86.3  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  35.42 
 
 
848 aa  86.3  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  41.75 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 
364 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  40.8 
 
 
357 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.03 
 
 
681 aa  85.5  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  37.9 
 
 
463 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0886  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.286498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
539 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0101  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  39.37 
 
 
803 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 
642 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 
199 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
755 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423484  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.79 
 
 
719 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 
512 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  37.01 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>