145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0512 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  100 
 
 
236 aa  477  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  68.75 
 
 
228 aa  321  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  64.25 
 
 
235 aa  286  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  49.09 
 
 
235 aa  226  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  43.52 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  39.81 
 
 
235 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  38.05 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  38.05 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  38.01 
 
 
234 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  34.98 
 
 
224 aa  155  7e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  40.62 
 
 
212 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  40.62 
 
 
212 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  37.36 
 
 
185 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  31.05 
 
 
236 aa  116  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  34.55 
 
 
208 aa  108  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  35.35 
 
 
231 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  33 
 
 
233 aa  106  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  36.42 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  36.96 
 
 
259 aa  95.9  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  27.32 
 
 
209 aa  95.9  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  31.21 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  33.5 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  32.86 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  31.6 
 
 
223 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  28.71 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  36.65 
 
 
235 aa  92.4  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  34.22 
 
 
224 aa  91.7  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0417  hypothetical protein  31.36 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.230267  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  36.7 
 
 
218 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  28.17 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  28.5 
 
 
230 aa  89.7  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  35.58 
 
 
248 aa  89  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  33.87 
 
 
244 aa  88.6  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  30.35 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  36.11 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  35.03 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0310  hypothetical protein  31.82 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  32.77 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  27.44 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0328  hypothetical protein  30.81 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.373253  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  29.95 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  30.1 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  30.1 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  30.56 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  30.32 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  29.5 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  28.02 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  36.09 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  29.81 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  28.02 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  31.9 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  35.86 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  30.86 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  32.45 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  32.58 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  30.37 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  28.83 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  30.73 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  30 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  26.6 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  26.6 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  30.37 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  27.07 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  24.73 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  25.81 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  31.22 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  31.22 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  31.22 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  27.43 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  31.38 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  27.68 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  26.34 
 
 
277 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  29.09 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  31.05 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  31.05 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  29.58 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  29.58 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  29.58 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  30.92 
 
 
249 aa  62.4  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  30.16 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0052  hypothetical protein  26.63 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  30.16 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  28.8 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  30.16 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3094  hypothetical protein  31.21 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  29.63 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  29.63 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  29.63 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  29.63 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  29.63 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  29.85 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  29.89 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  31.48 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  29.47 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  30.13 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  30.72 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>