40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0328 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0328  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.373253  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0310  hypothetical protein  99.15 
 
 
236 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392294  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  36.64 
 
 
236 aa  131  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  35.35 
 
 
228 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  31.53 
 
 
235 aa  85.9  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  30.81 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  32.49 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  27.4 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  27.73 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  33.12 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  33.12 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  27.62 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  27.62 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  29.94 
 
 
241 aa  62  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  27.14 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  26.18 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  23.33 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  27.93 
 
 
214 aa  52.4  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0060  hypothetical membrane spanning protein  27.27 
 
 
206 aa  52  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0028  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  52  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.275505  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  31.97 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  30.63 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  31.21 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  30.53 
 
 
233 aa  48.9  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  29.92 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  25.3 
 
 
185 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0417  hypothetical protein  28.32 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.230267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  27.04 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  28 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  29.87 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  28.38 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  27.33 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  26.36 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  30.37 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  22.22 
 
 
216 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  27.15 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  24.31 
 
 
277 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  28.17 
 
 
252 aa  41.6  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  28.17 
 
 
252 aa  41.6  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  29.1 
 
 
219 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>