38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0310 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0310  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  466  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0328  hypothetical protein  99.15 
 
 
236 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.373253  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0478  hypothetical protein  37.07 
 
 
236 aa  132  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  35.35 
 
 
228 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  32.43 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  31.82 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  28.64 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  27.85 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  32.49 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  34.42 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  34.42 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  27.62 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  27.62 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  29.34 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  26.18 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  26.13 
 
 
236 aa  55.5  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  23.89 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  28.49 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  33.61 
 
 
208 aa  52.8  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0060  hypothetical membrane spanning protein  26.7 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0028  hypothetical protein  26.7 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.275505  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  31.3 
 
 
233 aa  49.7  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  30 
 
 
285 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  30.71 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  25.9 
 
 
185 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0417  hypothetical protein  29.48 
 
 
230 aa  48.5  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.230267  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  30.37 
 
 
248 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  27.67 
 
 
224 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  28 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  26.82 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  23.12 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  27.7 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  22.81 
 
 
216 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  29.22 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  24.77 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  26.71 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  27.15 
 
 
221 aa  42.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  29.63 
 
 
219 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>