288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0544 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  100 
 
 		 155 aa  320  4e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  44.52 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  44.52 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  42.58 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  44.08 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  43.42 
 
 		 153 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  42.95 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  40.13 
 
 		 153 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  39.47 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  41.56 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  34.46 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  37.01 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  32.48 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  39.07 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  36.88 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  37.01 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  37.18 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  33.33 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  38.03 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  42.04 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  42.76 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 		 155 aa  94.4  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  34.76 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  49.5 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  30.32 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  40.13 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  41.72 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  49.5 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  35.22 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  49.5 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  46.08 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  49.06 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 		 155 aa  90.9  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  47.42 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  43.65 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  43.65 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  43.65 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  35.48 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  43.65 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  43.65 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  43.65 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  43.65 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  35.48 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  43.65 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  49.5 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  49.5 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  49.5 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  37.75 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  33.54 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  48.51 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  43.22 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  44.23 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  36.94 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  49.5 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  32.48 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  36.77 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  34.84 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  35.19 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  37.18 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 		 177 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  47.13 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34446  predicted protein  34.78 
 
 		 194 aa  87.4  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693948  normal  0.0400957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 159 aa  87  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  51.65 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0276  hypothetical protein  36.5 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.219326  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 185 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  31.79 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  30.57 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>