More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2540 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2540  peptidase M23B  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.258183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1457  peptidase M23B  44.69 
 
 		 241 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3330  Peptidase M23  38.52 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0172603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1947  Peptidase M23  38.36 
 
 		 221 aa  148  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.653444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  32.79 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  30.14 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  39.82 
 
 		 400 aa  86.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  32.92 
 
 		 430 aa  86.3  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  36.97 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0548  peptidase M23B  31.13 
 
 		 244 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00447609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  38.79 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.48 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  34.85 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  36.29 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  35.83 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  36.29 
 
 		 372 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  32.02 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  37.96 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  36.89 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  33.33 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  37.96 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  36.28 
 
 		 503 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  34.53 
 
 		 402 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.29 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  35.25 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  33.09 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  38.02 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  34.4 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  31.97 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  35.2 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  34.96 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  33.6 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  26.74 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  33.6 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  33.06 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  33.58 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  37.04 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  37.9 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  35.71 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  36.51 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  32.81 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  27.74 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  34.85 
 
 		 465 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  34.15 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  34.35 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  33.33 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  36.89 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  29.59 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  35.25 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  34.92 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  33.05 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  31.2 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  33.33 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  30.77 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  32.09 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  33.33 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  31.01 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  30.32 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  33.59 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2373  peptidase M23B  33.33 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597267 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  33.59 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  33.59 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  33.59 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  36.89 
 
 		 501 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  33.59 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  29.49 
 
 		 420 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  32.82 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  35.21 
 
 		 472 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  35.21 
 
 		 471 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  33.59 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  33.59 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  35.21 
 
 		 512 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  35.77 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  26.6 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  35.21 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  29.49 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.33 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  34.33 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  35.21 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  33.59 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  33.33 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  36.07 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  32.48 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  30.87 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  29.68 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  31.97 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  35.22 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  32.26 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  33.61 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  30.2 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  40.82 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  37.82 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  33.59 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  36.89 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  30.2 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  30.2 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  34.15 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  33.33 
 
 		 538 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  36.07 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  29.03 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>