More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1259 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 421 aa  858    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  60.93 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  58.66 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  52.06 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  53.45 
 
 		 413 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  49.88 
 
 		 454 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  54.9 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  52.59 
 
 		 582 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  49.76 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  48.49 
 
 		 444 aa  363  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  46.41 
 
 		 509 aa  362  7.0000000000000005e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  47.03 
 
 		 419 aa  358  7e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  47.03 
 
 		 419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.41 
 
 		 493 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  46.78 
 
 		 419 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  47.03 
 
 		 419 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  47.92 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  46.29 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  46.78 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  46.78 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  48.41 
 
 		 515 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  46.78 
 
 		 419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  46.78 
 
 		 419 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  46.78 
 
 		 419 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  48.11 
 
 		 435 aa  353  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.87 
 
 		 436 aa  352  5e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  48.11 
 
 		 433 aa  350  3e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  48.85 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  48.78 
 
 		 502 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  48.85 
 
 		 414 aa  349  5e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  51.23 
 
 		 501 aa  349  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  49.26 
 
 		 487 aa  348  9e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  48.93 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  49.03 
 
 		 521 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  47.95 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  48.61 
 
 		 515 aa  346  4e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  48.31 
 
 		 401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  49.26 
 
 		 493 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  47.6 
 
 		 530 aa  342  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  47.85 
 
 		 485 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  49.75 
 
 		 596 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  50 
 
 		 494 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  48.45 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  47.69 
 
 		 512 aa  333  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  49.29 
 
 		 553 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  55.31 
 
 		 509 aa  332  6e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  47.71 
 
 		 512 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  49.5 
 
 		 546 aa  331  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  46.06 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  48.59 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  53.24 
 
 		 528 aa  329  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  51.39 
 
 		 574 aa  329  5.0000000000000004e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  53.85 
 
 		 564 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  47.84 
 
 		 505 aa  329  6e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  46.97 
 
 		 445 aa  329  7e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  49.25 
 
 		 493 aa  329  7e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  53.85 
 
 		 564 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.06 
 
 		 486 aa  328  8e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  47.31 
 
 		 420 aa  328  8e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  48.33 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  46.1 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  46.84 
 
 		 517 aa  327  4.0000000000000003e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  46.48 
 
 		 434 aa  325  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  50.97 
 
 		 375 aa  325  9e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  48.94 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  48.71 
 
 		 553 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  43.94 
 
 		 484 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  46.11 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  45.95 
 
 		 522 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.01 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  52.39 
 
 		 583 aa  322  8e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  46.41 
 
 		 440 aa  322  9.000000000000001e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  49.42 
 
 		 412 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  45.22 
 
 		 512 aa  322  9.999999999999999e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  42.36 
 
 		 519 aa  320  3e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  47.63 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  43.42 
 
 		 412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  45.65 
 
 		 429 aa  319  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  43.03 
 
 		 415 aa  318  9e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  45.41 
 
 		 431 aa  318  9e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  45.11 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  53.56 
 
 		 535 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  44.95 
 
 		 501 aa  316  6e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  46.6 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  45.11 
 
 		 425 aa  316  6e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  49.86 
 
 		 425 aa  315  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  49.59 
 
 		 424 aa  315  8e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  45.34 
 
 		 429 aa  315  9e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  46.06 
 
 		 428 aa  315  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  44.81 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  52.98 
 
 		 354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  49.59 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  46.31 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  46.31 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  46.31 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  49.47 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  46.31 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  48.8 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  50.77 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  45.3 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>