185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2429 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  989    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  38.84 
 
 		 481 aa  290  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  38 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  35.31 
 
 		 447 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  35.31 
 
 		 447 aa  263  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  33.27 
 
 		 522 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  42.22 
 
 		 274 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  40.15 
 
 		 268 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  41.58 
 
 		 282 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  41.85 
 
 		 264 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  30.31 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  39.7 
 
 		 267 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  38.97 
 
 		 274 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  29.44 
 
 		 438 aa  156  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  37.73 
 
 		 266 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  36 
 
 		 276 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  45.03 
 
 		 197 aa  153  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  40.3 
 
 		 267 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  35.58 
 
 		 282 aa  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  34.83 
 
 		 268 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  28.1 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  39.85 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  47.8 
 
 		 188 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  35.29 
 
 		 270 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  35.94 
 
 		 278 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  48 
 
 		 180 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  34.22 
 
 		 263 aa  140  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  38.95 
 
 		 274 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  34.8 
 
 		 254 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  31.11 
 
 		 262 aa  137  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  30.8 
 
 		 265 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  45.58 
 
 		 180 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  42.58 
 
 		 190 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  32.21 
 
 		 274 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  30.74 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  46.1 
 
 		 194 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0397  AMMECR1  41.53 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0573  conserved hypothetical protein TIGR00296  42.78 
 
 		 202 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0727  AMMECR1 domain protein  42.78 
 
 		 202 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  hitchhiker  0.000000239673 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  30.07 
 
 		 275 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  35.02 
 
 		 275 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  32.74 
 
 		 287 aa  127  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  35.19 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  34.91 
 
 		 271 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  38.62 
 
 		 202 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  32.97 
 
 		 262 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  34.07 
 
 		 265 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  32.14 
 
 		 284 aa  123  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  31.5 
 
 		 267 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  30.04 
 
 		 262 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  35.98 
 
 		 268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  34.39 
 
 		 285 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  39.47 
 
 		 202 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  35.4 
 
 		 267 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  35.11 
 
 		 208 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  35.11 
 
 		 203 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  33.94 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  30.71 
 
 		 269 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  30.47 
 
 		 282 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  34.9 
 
 		 208 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  40.41 
 
 		 200 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0896  AMMECR1 domain-containing protein  34.05 
 
 		 199 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  30.96 
 
 		 281 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  29.75 
 
 		 282 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  30.94 
 
 		 267 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2619  AMMECR1 domain-containing protein  38.82 
 
 		 198 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.54794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  34.42 
 
 		 265 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  32.17 
 
 		 283 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  39.64 
 
 		 254 aa  110  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  31.87 
 
 		 267 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  30.1 
 
 		 284 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  34.42 
 
 		 282 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  30.47 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  39.23 
 
 		 184 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  34.48 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  33.85 
 
 		 203 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  29.68 
 
 		 284 aa  107  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  29.45 
 
 		 271 aa  107  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  32.14 
 
 		 284 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  29.58 
 
 		 284 aa  106  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  29.47 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  35.98 
 
 		 184 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  30.58 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  32.01 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  38.51 
 
 		 202 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0930  AMMECR1 domain-containing protein  39.29 
 
 		 191 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  30.47 
 
 		 277 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  37.57 
 
 		 184 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  37.04 
 
 		 221 aa  103  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  34.38 
 
 		 180 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  30.85 
 
 		 281 aa  103  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1056  AMMECR1 domain-containing protein  34.67 
 
 		 203 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  30.99 
 
 		 281 aa  103  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  28.1 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  32.4 
 
 		 205 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  34.95 
 
 		 191 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  33.45 
 
 		 266 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  37.63 
 
 		 200 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  31.16 
 
 		 264 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>