More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1806 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  100 
 
 		 310 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  32.42 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  31.47 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 353 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.67 
 
 		 353 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  29.88 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  29.3 
 
 		 358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  27.35 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.52 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  31.9 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  29.55 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  28.85 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  31.05 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.83 
 
 		 672 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 214 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  26.77 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  25.18 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  27.46 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  24.8 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  27.69 
 
 		 332 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  26.45 
 
 		 285 aa  89  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  27.03 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.6 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  33.57 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  31.98 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  27.65 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  29.51 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  35.06 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  25.25 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  26.27 
 
 		 607 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  27.4 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  27.09 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  26.89 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.01 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  27.35 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  28.08 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  24.57 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  23.74 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  23.19 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.34 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  28.63 
 
 		 625 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  30.41 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  24.11 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  25.23 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.68 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  24.81 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  24.14 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  20.7 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  33.33 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  33.33 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  36.96 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  32.5 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0194  hypothetical protein  26.74 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.88 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  21.28 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  25.54 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  31.25 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  32.5 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  35.87 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  32.5 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  26.03 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  23.56 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  23.56 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  26.97 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  22.27 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  25.47 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 197 aa  57  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 211 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>