168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0579 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  71.37 
 
 
248 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  69.39 
 
 
248 aa  354  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  65.59 
 
 
248 aa  354  6.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  65.85 
 
 
248 aa  340  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  65.04 
 
 
248 aa  340  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  32.66 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  30.45 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 
249 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  28.22 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 
269 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  26.94 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.52 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  28.99 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  31.58 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  29.95 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 
285 aa  62  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  27.12 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  26.11 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.11 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  26.11 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  25.62 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
297 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  31.65 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  25.62 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
284 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  29.87 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 
324 aa  59.3  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 
288 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  27.56 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  27.98 
 
 
299 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  29.3 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  29.94 
 
 
284 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 
209 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 
207 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 
311 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 
294 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 
208 aa  55.8  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  29.22 
 
 
284 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  29.3 
 
 
284 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 
269 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  29.3 
 
 
284 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  25.43 
 
 
299 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  29.3 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  29.3 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  29.3 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  27.59 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  28.87 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  30.53 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  29.3 
 
 
284 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 
329 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 
327 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
287 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 
332 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  29.03 
 
 
265 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
298 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1053  beta-lactamase domain protein  32.6 
 
 
322 aa  52.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  23.91 
 
 
297 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  29.91 
 
 
282 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 
302 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 
324 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  26.44 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 
326 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  28 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 
282 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  26.35 
 
 
302 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  24.05 
 
 
271 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  26.24 
 
 
302 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 
302 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 
282 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  26.22 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 
282 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  27.38 
 
 
283 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  29.79 
 
 
229 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  23.29 
 
 
339 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
283 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 
336 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 
233 aa  48.5  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 
315 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>