More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0229 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 384 aa  781    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  49.09 
 
 		 386 aa  338  7e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  46.6 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  47.63 
 
 		 385 aa  333  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  51.49 
 
 		 481 aa  328  9e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  45.95 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  43.77 
 
 		 426 aa  316  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  44.47 
 
 		 412 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  42.56 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  43.23 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  46.26 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  46.26 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  42.89 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  45.4 
 
 		 418 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  46.21 
 
 		 422 aa  292  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  39.84 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  42.41 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  44.01 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  43.5 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  43.67 
 
 		 417 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  43.9 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  46.79 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  42.04 
 
 		 399 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  43.38 
 
 		 424 aa  279  5e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  40.67 
 
 		 410 aa  279  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  41.93 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  39.22 
 
 		 410 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  38.76 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  44.25 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  45.58 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  39.22 
 
 		 409 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  42.56 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  41.78 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  41.73 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  41.73 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  40.62 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  41.88 
 
 		 417 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  43.02 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  42.69 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  40.53 
 
 		 453 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  44.23 
 
 		 379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  40.99 
 
 		 406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  42.86 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  43.31 
 
 		 360 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  39.9 
 
 		 423 aa  265  8.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  42.11 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  41.36 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  44.42 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  39.74 
 
 		 413 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  40.68 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  40.58 
 
 		 419 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  42.06 
 
 		 425 aa  262  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  43.83 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  44.05 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  44.05 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  44.05 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  41.54 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  42.4 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  38.96 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  40 
 
 		 445 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  43.32 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  42.7 
 
 		 359 aa  259  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  40.97 
 
 		 369 aa  259  7e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  43.34 
 
 		 358 aa  258  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  38.18 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  39.21 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  43.02 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  38.95 
 
 		 431 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  40.21 
 
 		 418 aa  256  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  39.74 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  42.43 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  42.14 
 
 		 375 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  40 
 
 		 432 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  39.71 
 
 		 371 aa  256  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  39.21 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  41.07 
 
 		 358 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  41.21 
 
 		 430 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  39.88 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  43.15 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  40.47 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  41.43 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  42.54 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  43.01 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  39.7 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 		 430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  42.15 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  39.59 
 
 		 421 aa  253  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  42.27 
 
 		 423 aa  252  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  40.42 
 
 		 431 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  43.53 
 
 		 360 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  43.77 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.21 
 
 		 415 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  40.77 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  40 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  40.48 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  43.85 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  43.85 
 
 		 400 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  43.85 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  43.85 
 
 		 400 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>