More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2770 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
143 aa  298  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.48 
 
 
146 aa  156  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  54.55 
 
 
154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  46.21 
 
 
150 aa  147  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  47.69 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.88 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  46.38 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  47.33 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.97 
 
 
138 aa  124  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  48.89 
 
 
144 aa  124  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.72 
 
 
152 aa  123  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.41 
 
 
143 aa  120  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.21 
 
 
157 aa  117  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  42.86 
 
 
144 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  44.12 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.54 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  44.09 
 
 
132 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.54 
 
 
137 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  45.26 
 
 
144 aa  110  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  42.62 
 
 
143 aa  110  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.69 
 
 
139 aa  110  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  45.11 
 
 
144 aa  110  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  40.94 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.94 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  45.3 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
257 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
254 aa  107  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  43.9 
 
 
138 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  45.04 
 
 
142 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  43.18 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.86 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
275 aa  105  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  40.74 
 
 
148 aa  105  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  44.27 
 
 
142 aa  105  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  44.96 
 
 
142 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.16 
 
 
137 aa  104  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
255 aa  103  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 
151 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  39.84 
 
 
144 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
258 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  38.35 
 
 
254 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
140 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  39.57 
 
 
143 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  41.48 
 
 
175 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.11 
 
 
175 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
258 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 
138 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 
138 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
173 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.98 
 
 
299 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.17 
 
 
137 aa  100  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  39.02 
 
 
138 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  42.74 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.97 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13220  protein-tyrosine-phosphatase  35.92 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211639  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.8 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  41.98 
 
 
299 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  35.88 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  39.02 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 
175 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  35.38 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
170 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.48 
 
 
287 aa  97.1  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  38.24 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  40.77 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
143 aa  95.9  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  37.21 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  41.18 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.85 
 
 
175 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.35 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  37.01 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.44 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  40.16 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  40.18 
 
 
258 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  41.01 
 
 
287 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  38.97 
 
 
163 aa  94  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  43.94 
 
 
171 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  37.69 
 
 
270 aa  93.6  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2792  protein tyrosine phosphatase  42.5 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  37.21 
 
 
134 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  38.58 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
270 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 
141 aa  92  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
276 aa  92  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  37.21 
 
 
134 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  40.41 
 
 
317 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  37.01 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.6 
 
 
142 aa  92  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  39.26 
 
 
173 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  39.37 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  35.51 
 
 
182 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>