More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2122 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0554  extracellular solute-binding protein  66.61 
 
 
581 aa  770    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2122  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
573 aa  1170    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.973923 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0475  4-phytase  35.22 
 
 
614 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0460  4-phytase  35.16 
 
 
615 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0133  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 
576 aa  336  5.999999999999999e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1849  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 
614 aa  336  7e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000095247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04900  extracellular solute-binding protein family 5  34.48 
 
 
601 aa  326  9e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0348  extracellular solute-binding protein  33.55 
 
 
617 aa  318  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.663793  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1729  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 
615 aa  308  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000266848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1575  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
617 aa  305  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000589717  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  32.49 
 
 
566 aa  246  6e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 
515 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 
525 aa  169  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 
523 aa  162  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 
544 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 
535 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  28.91 
 
 
544 aa  159  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.74 
 
 
520 aa  158  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 
535 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.04 
 
 
509 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.9 
 
 
526 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.9 
 
 
526 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 
535 aa  154  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.9 
 
 
526 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 
501 aa  154  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  27.47 
 
 
532 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.71 
 
 
526 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 
535 aa  153  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.27 
 
 
541 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.71 
 
 
526 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.92 
 
 
535 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  26.94 
 
 
532 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
535 aa  150  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
501 aa  150  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.44 
 
 
535 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  25.44 
 
 
535 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  25.44 
 
 
535 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.44 
 
 
535 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.44 
 
 
535 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  25.44 
 
 
535 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  25.44 
 
 
535 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.44 
 
 
535 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
530 aa  146  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
535 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 
534 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
531 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 
505 aa  143  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
538 aa  143  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
531 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
532 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.91 
 
 
531 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
531 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.09 
 
 
528 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 
506 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 
528 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 
542 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
531 aa  140  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.18 
 
 
516 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  25.85 
 
 
526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.18 
 
 
516 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.7 
 
 
516 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
516 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  24.58 
 
 
531 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.38 
 
 
528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  26.26 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.26 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  26.26 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 
516 aa  135  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  26.38 
 
 
516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.76 
 
 
531 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0422  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 
531 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00166095  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
582 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.19 
 
 
528 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.19 
 
 
528 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.19 
 
 
528 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.19 
 
 
528 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.19 
 
 
528 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.19 
 
 
528 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
533 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  26.06 
 
 
531 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6093  putative dipeptide ABC transporter binding protein subunit  25.09 
 
 
526 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
532 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.82 
 
 
516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.7 
 
 
532 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
532 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.7 
 
 
532 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
545 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 
547 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.07 
 
 
565 aa  130  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 
547 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0390  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 
531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18086  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 
531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>