More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0912 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 403 aa  823    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  68.37 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  65.84 
 
 		 414 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  57.33 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  56.81 
 
 		 417 aa  448  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.39 
 
 		 411 aa  450  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.36 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.24 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.24 
 
 		 389 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.79 
 
 		 390 aa  434  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.33 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.38 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.78 
 
 		 422 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  51.97 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.97 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  50.62 
 
 		 483 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  51.98 
 
 		 457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  51.48 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.24 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  49.38 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.5 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  48.89 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  49.88 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  48.65 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.87 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.25 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.96 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  51.33 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  47.78 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  49.88 
 
 		 438 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  47.52 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  48.28 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  47.52 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.64 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  48.89 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  47.52 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  47.52 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  47.68 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  48.32 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  50.49 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  48.16 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  46.09 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.94 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.02 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  45.83 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  46.1 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  46.1 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  47.42 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  45.57 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  45.85 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  46.44 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  45.16 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.15 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.61 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.04 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.51 
 
 		 396 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.54 
 
 		 449 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 417 aa  362  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0781  NADH dehydrogenase subunit D  46.08 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.673005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 417 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.53 
 
 		 792 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.25 
 
 		 396 aa  362  8e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.25 
 
 		 396 aa  362  8e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 417 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  44.63 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  44.88 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  46.21 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.3 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  44.88 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  44.65 
 
 		 416 aa  360  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  44.15 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.74 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  46.25 
 
 		 416 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  359  6e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.25 
 
 		 396 aa  358  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.59 
 
 		 426 aa  358  7e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.12 
 
 		 417 aa  358  8e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  44.9 
 
 		 392 aa  358  9e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>