152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2508 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  100 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  61.26 
 
 		 199 aa  257  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  60.11 
 
 		 199 aa  257  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  68.75 
 
 		 185 aa  251  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  68.36 
 
 		 194 aa  250  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  59.87 
 
 		 175 aa  177  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  46.55 
 
 		 179 aa  161  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  48.43 
 
 		 183 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  50.32 
 
 		 178 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  43.93 
 
 		 207 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  48.1 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  48.41 
 
 		 178 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  49.69 
 
 		 182 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  45.57 
 
 		 189 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  50.74 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  50.74 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  50 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  50 
 
 		 182 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  50 
 
 		 182 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  50 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  50 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  49.64 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  47.53 
 
 		 186 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  42.14 
 
 		 184 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  46.63 
 
 		 190 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  45.68 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  44.94 
 
 		 202 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  44.17 
 
 		 182 aa  121  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  50.39 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  42.94 
 
 		 176 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  40.86 
 
 		 188 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  44.96 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  41.4 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  32.32 
 
 		 180 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  35.03 
 
 		 449 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  33.9 
 
 		 379 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  35.29 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  40 
 
 		 164 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  38.89 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  36.08 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  36.71 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  38.36 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  36.08 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  37.18 
 
 		 394 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  39.49 
 
 		 383 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  36.71 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  36.08 
 
 		 184 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  34.46 
 
 		 164 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  36.08 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  35.44 
 
 		 184 aa  101  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  44 
 
 		 391 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  38.06 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  35.09 
 
 		 379 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  34.81 
 
 		 184 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  36.31 
 
 		 361 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  34.81 
 
 		 379 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  35.67 
 
 		 379 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  34.29 
 
 		 373 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 		 325 aa  95.5  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  38.41 
 
 		 175 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  39.53 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  38.01 
 
 		 400 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  33.93 
 
 		 465 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  33.93 
 
 		 397 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  33.93 
 
 		 382 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  33.93 
 
 		 397 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  33.93 
 
 		 397 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  30.38 
 
 		 286 aa  92  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  33.93 
 
 		 382 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  36.79 
 
 		 389 aa  92  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  36.13 
 
 		 324 aa  91.7  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  41.46 
 
 		 378 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  34.93 
 
 		 416 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  36.48 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  34.18 
 
 		 384 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  40.3 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  41.22 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  39.35 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 376 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  36.25 
 
 		 392 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  33.54 
 
 		 384 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  32.91 
 
 		 384 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  36.24 
 
 		 344 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  30.93 
 
 		 387 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  32.97 
 
 		 404 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  37.98 
 
 		 173 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  38.4 
 
 		 120 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 		 410 aa  85.5  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  37.8 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  37.09 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  31.95 
 
 		 390 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  33.1 
 
 		 167 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  32.08 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  31.36 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  33.78 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  36.15 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>