More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1803 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  70.89 
 
 
79 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  66.23 
 
 
79 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  63.64 
 
 
81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  63.64 
 
 
79 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  61.84 
 
 
81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  57.89 
 
 
90 aa  100  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  59.21 
 
 
81 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 
81 aa  99.4  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  55.84 
 
 
86 aa  97.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  55.84 
 
 
86 aa  97.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 
86 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  55.41 
 
 
82 aa  96.7  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  56.76 
 
 
139 aa  95.9  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 
81 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  55.26 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  54.05 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  53.33 
 
 
84 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 
91 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  56 
 
 
81 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
90 aa  90.5  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 
90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  88.6  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
87 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 
81 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 
81 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 
90 aa  88.2  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  52.63 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  48 
 
 
96 aa  87  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  48 
 
 
131 aa  87  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  50 
 
 
89 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  86.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  48.68 
 
 
81 aa  86.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  50 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  48.05 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4357  30S ribosomal protein S16  54.67 
 
 
86 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000000929169  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  46.75 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  47.3 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 
90 aa  84.3  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  48 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  49.33 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  84  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  46.75 
 
 
81 aa  84  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 
88 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2536  SSU ribosomal protein S16P  54.05 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000571366  decreased coverage  0.00236598 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  48.65 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  44.16 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  52.7 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  45.88 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  43.42 
 
 
168 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1143  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0121256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  45.95 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  44.74 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  46.67 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  48 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  45.95 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  48 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  45.95 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  47.95 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  45.21 
 
 
80 aa  80.5  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  43.42 
 
 
158 aa  80.1  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0883  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738027  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  43.42 
 
 
80 aa  80.5  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  44 
 
 
86 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1516  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  44 
 
 
86 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 
87 aa  79.3  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  46.67 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13321  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.257146  normal  0.676995 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1501  ribosomal protein S16  49.33 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.019119  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  44 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  43.42 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1148  30S ribosomal protein S16  46.67 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0271255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  47.3 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>