More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2536 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2536  SSU ribosomal protein S16P  100 
 
 		 141 aa  283  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000571366  decreased coverage  0.00236598 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1143  30S ribosomal protein S16  83.33 
 
 		 86 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0121256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4357  30S ribosomal protein S16  83.33 
 
 		 86 aa  141  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000000929169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1956  30S ribosomal protein S16  83.33 
 
 		 82 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1983  30S ribosomal protein S16  83.33 
 
 		 82 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5264  30S ribosomal protein S16  82.05 
 
 		 82 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1772  30S ribosomal protein S16  80.77 
 
 		 82 aa  135  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13321  30S ribosomal protein S16  73.08 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.257146  normal  0.676995 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2772  30S ribosomal protein S16  72.84 
 
 		 82 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.48934 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0852  30S ribosomal protein S16  71.79 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14841  30S ribosomal protein S16  71.79 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321531  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17051  30S ribosomal protein S16  71.79 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.701921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14461  30S ribosomal protein S16  71.79 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19551  30S ribosomal protein S16  70.51 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.669471 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0883  30S ribosomal protein S16  71.79 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1381  30S ribosomal protein S16  70.51 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1516  30S ribosomal protein S16  60.2 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14701  30S ribosomal protein S16  70.51 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  58.11 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  52.7 
 
 		 79 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf245  ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00213273  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000161695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  46.67 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 183 aa  77  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  43.59 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  47.73 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  47.73 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  48.1 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  50 
 
 		 191 aa  73.6  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  43.04 
 
 		 81 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  47.44 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1447  ribosomal protein S16  45 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  47.44 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  45.57 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  45.83 
 
 		 188 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  43.04 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  41.38 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1863  ribosomal protein S16  44.44 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000617647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  41.38 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  42.05 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  32.86 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  44.59 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  44.59 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  44 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  41.56 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  46.58 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  40.23 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  40.23 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  40.23 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  40.23 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  40.23 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  40.23 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  40.23 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  40.23 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  40.23 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  40.79 
 
 		 80 aa  67  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  44.59 
 
 		 168 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  43.04 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  43.84 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  45 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  40.74 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  39.74 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  39.74 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  38.75 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  45.21 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  43.04 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  34.65 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  43.84 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  42.11 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  43.84 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  41.56 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  45.21 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  38.75 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  46.67 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  41.77 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1153  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  39.24 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>