More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3078 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  100 
 
 		 280 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  73.57 
 
 		 281 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  73.67 
 
 		 281 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  65.59 
 
 		 278 aa  377  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  64.06 
 
 		 283 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  61.32 
 
 		 284 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  61.32 
 
 		 284 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.58 
 
 		 286 aa  350  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.43 
 
 		 281 aa  332  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.59 
 
 		 290 aa  331  9e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  60.49 
 
 		 285 aa  329  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  61.67 
 
 		 286 aa  329  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.86 
 
 		 276 aa  322  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.93 
 
 		 288 aa  322  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.83 
 
 		 277 aa  318  7e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.56 
 
 		 284 aa  317  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.18 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.67 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  55.15 
 
 		 291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.15 
 
 		 291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.06 
 
 		 296 aa  310  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.79 
 
 		 306 aa  309  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  52.38 
 
 		 312 aa  305  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.25 
 
 		 294 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.92 
 
 		 294 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.36 
 
 		 298 aa  289  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.88 
 
 		 293 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.63 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.01 
 
 		 277 aa  278  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  47 
 
 		 329 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.51 
 
 		 291 aa  268  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.67 
 
 		 344 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  38.44 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  39.31 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  36.61 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  35.26 
 
 		 323 aa  168  8e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  32.4 
 
 		 330 aa  168  9e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  35.62 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  34.59 
 
 		 323 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  34.59 
 
 		 323 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  33.85 
 
 		 333 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  33.65 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  33.96 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  33.01 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.31 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.16 
 
 		 203 aa  159  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.75 
 
 		 329 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.11 
 
 		 203 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.62 
 
 		 200 aa  155  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  42.11 
 
 		 203 aa  153  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.32 
 
 		 145 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  57.63 
 
 		 149 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  58.47 
 
 		 129 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.53 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  40.43 
 
 		 203 aa  147  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.56 
 
 		 127 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.76 
 
 		 207 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.72 
 
 		 150 aa  145  9e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.55 
 
 		 154 aa  145  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.93 
 
 		 124 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.93 
 
 		 142 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  55.93 
 
 		 144 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  38.95 
 
 		 203 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  58.97 
 
 		 173 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  57.26 
 
 		 143 aa  143  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.23 
 
 		 137 aa  143  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.07 
 
 		 153 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  47.18 
 
 		 144 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.99 
 
 		 146 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  54.24 
 
 		 125 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  54.24 
 
 		 143 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.08 
 
 		 138 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  53.39 
 
 		 139 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.26 
 
 		 137 aa  138  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  57.63 
 
 		 153 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  52.99 
 
 		 123 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.69 
 
 		 124 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  50.43 
 
 		 129 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50 
 
 		 131 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  51.69 
 
 		 122 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  53.72 
 
 		 130 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  55.93 
 
 		 147 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  51.22 
 
 		 139 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  48.31 
 
 		 129 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  48.39 
 
 		 133 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  57.63 
 
 		 129 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  49.57 
 
 		 133 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  47.93 
 
 		 150 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  48.76 
 
 		 133 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.59 
 
 		 133 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.93 
 
 		 128 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  50.41 
 
 		 127 aa  122  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  47.93 
 
 		 153 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  50 
 
 		 127 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.93 
 
 		 128 aa  122  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.59 
 
 		 134 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  48.39 
 
 		 127 aa  122  9e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  48.33 
 
 		 211 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.76 
 
 		 135 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>