More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2320 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2320  DnaA family protein  100 
 
 
461 aa  949    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0326594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  61.12 
 
 
498 aa  624  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184051 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0991  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.47 
 
 
504 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00365365  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.66 
 
 
449 aa  482  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0785  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.01 
 
 
460 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0833  Chromosomal replication initiator DnaA  46.22 
 
 
482 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.093159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.78 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.97 
 
 
460 aa  247  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  34.23 
 
 
472 aa  246  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.82 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  34.82 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 
467 aa  244  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.53 
 
 
483 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  34.6 
 
 
467 aa  242  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  34.63 
 
 
462 aa  242  9e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  34 
 
 
466 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  34 
 
 
466 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  34 
 
 
466 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  34 
 
 
466 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  34 
 
 
466 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  33.64 
 
 
462 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  33.79 
 
 
462 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  34.11 
 
 
468 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  34.79 
 
 
461 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  34.57 
 
 
468 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  34.61 
 
 
462 aa  237  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  34.61 
 
 
462 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  34.03 
 
 
460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  34.03 
 
 
460 aa  236  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  34.03 
 
 
460 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  33.71 
 
 
461 aa  236  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.16 
 
 
462 aa  236  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  35.21 
 
 
455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  33.8 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  34.45 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  34.1 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  34.1 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  34.1 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  34.1 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.93 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  34.71 
 
 
450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  34.23 
 
 
465 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  34 
 
 
463 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  34.35 
 
 
457 aa  233  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  34.1 
 
 
461 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  31.31 
 
 
460 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
478 aa  229  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  30.61 
 
 
458 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  33.03 
 
 
468 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  33.72 
 
 
459 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  29.84 
 
 
443 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  35.42 
 
 
449 aa  226  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  31.7 
 
 
482 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  32.13 
 
 
494 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  29.65 
 
 
481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  31.71 
 
 
445 aa  223  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  31.94 
 
 
465 aa  222  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000010295  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  30.87 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  29.58 
 
 
487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.67 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.94 
 
 
451 aa  220  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  32.94 
 
 
451 aa  220  3e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  30.18 
 
 
449 aa  220  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  30.72 
 
 
452 aa  220  5e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  30.72 
 
 
452 aa  220  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  34.86 
 
 
451 aa  220  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  31.93 
 
 
452 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  28.03 
 
 
489 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0001  chromosomal replication initiator protein, DnaA  32.81 
 
 
449 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  30.44 
 
 
480 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.57 
 
 
461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.02 
 
 
456 aa  217  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  31.85 
 
 
495 aa  216  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  32 
 
 
442 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.8 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000188551  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  30.12 
 
 
511 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  30.6 
 
 
510 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  29.46 
 
 
450 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  31.03 
 
 
470 aa  213  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.89 
 
 
475 aa  213  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  30.45 
 
 
477 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  29.87 
 
 
472 aa  213  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.26 
 
 
453 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  28.31 
 
 
491 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.21 
 
 
470 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  29.71 
 
 
491 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  30.67 
 
 
460 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.18 
 
 
444 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  31.46 
 
 
452 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  30.5 
 
 
505 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.83 
 
 
443 aa  211  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.53 
 
 
467 aa  210  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720821  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  28.85 
 
 
454 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.25 
 
 
446 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.99 
 
 
509 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>