99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0572 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  83.63 
 
 
396 aa  683    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  80.82 
 
 
396 aa  673    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
398 aa  835    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  79.29 
 
 
396 aa  675    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  75.56 
 
 
403 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  70.45 
 
 
399 aa  588  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  68.72 
 
 
398 aa  584  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  67.68 
 
 
409 aa  580  1e-164  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  66.08 
 
 
399 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  66.16 
 
 
401 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  68.46 
 
 
398 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  68.72 
 
 
399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  67.76 
 
 
392 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  67.34 
 
 
401 aa  570  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  67.09 
 
 
397 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  66.5 
 
 
399 aa  567  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  68.46 
 
 
399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  67.18 
 
 
398 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  67.77 
 
 
395 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  68.72 
 
 
398 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  66.67 
 
 
402 aa  552  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  63.73 
 
 
403 aa  553  1e-156  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  66.84 
 
 
401 aa  548  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  63.61 
 
 
400 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  67.69 
 
 
398 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  64.65 
 
 
403 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  63.61 
 
 
400 aa  545  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  61.46 
 
 
403 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  63.32 
 
 
405 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  61.22 
 
 
401 aa  536  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  61.71 
 
 
404 aa  537  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  63.29 
 
 
405 aa  535  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  61.73 
 
 
401 aa  535  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  61.32 
 
 
397 aa  532  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  61.22 
 
 
401 aa  532  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  60.97 
 
 
401 aa  529  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  63.22 
 
 
404 aa  529  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  62.06 
 
 
405 aa  526  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  60.2 
 
 
394 aa  521  1e-147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  61.64 
 
 
399 aa  518  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  46.52 
 
 
417 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  46.27 
 
 
414 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  44.28 
 
 
414 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  44.53 
 
 
414 aa  368  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  45.5 
 
 
405 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  42.71 
 
 
413 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  43.86 
 
 
412 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  43.18 
 
 
413 aa  344  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  43.18 
 
 
413 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  42.86 
 
 
412 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  42.96 
 
 
413 aa  342  9e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  42.68 
 
 
426 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  43.18 
 
 
412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  43.18 
 
 
412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  42.17 
 
 
413 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  41.27 
 
 
412 aa  326  5e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  40.66 
 
 
414 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  40.66 
 
 
414 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  40.2 
 
 
424 aa  313  4.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  39.95 
 
 
424 aa  311  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  41.15 
 
 
422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  39.74 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  39.48 
 
 
399 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  41.75 
 
 
407 aa  305  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  33.08 
 
 
408 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  31.68 
 
 
403 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  32.61 
 
 
407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  30.94 
 
 
407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  30.69 
 
 
407 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  30.69 
 
 
407 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  33.04 
 
 
401 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.77 
 
 
398 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.91 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  23.67 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.06 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  21.8 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  22.84 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  22.19 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  23.41 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  23 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  25.28 
 
 
454 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  22.34 
 
 
446 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  22.04 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  22.65 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  22.65 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  22.65 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  22.65 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  22.48 
 
 
748 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  21.38 
 
 
394 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  25.13 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  22.26 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  24.75 
 
 
350 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  21.41 
 
 
384 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  21.17 
 
 
369 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  22.84 
 
 
394 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  21.78 
 
 
392 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  21.78 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  25.38 
 
 
360 aa  46.6  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  23.44 
 
 
554 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.529688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>