94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1330 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1330  galactoside permease  100 
 
 		 426 aa  856    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2657  galactoside permease  91.78 
 
 		 426 aa  724    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4076  galactoside permease  77.62 
 
 		 421 aa  602  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3115  galactoside permease  72.06 
 
 		 425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3381  galactoside permease  72.3 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0632  galactoside permease  72.64 
 
 		 420 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0846  galactoside permease  71.95 
 
 		 420 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2394  galactoside permease  61.2 
 
 		 435 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000789855  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2492  galactoside permease  61.46 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1680  galactoside permease  61.46 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1767  galactoside permease  62.31 
 
 		 418 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0531388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1361  galactoside permease  61.56 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.32292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0407  galactoside permease  60.37 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00583816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0367  galactoside permease  60.63 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00932691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3282  galactoside permease  60.63 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00177774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0416  galactoside permease  60.37 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3263  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  60.63 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0568399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0374  galactoside permease  60.63 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131183  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00297  galactoside permease  60.63 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0372048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3102  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  57.25 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  50.87 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.02 
 
 		 410 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2083  galactoside permease  46.13 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51800  galactoside permease  41.18 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  37.44 
 
 		 422 aa  276  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  35.83 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  33.5 
 
 		 415 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  30.75 
 
 		 445 aa  202  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000688669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  24.6 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  25.34 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.25 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.88 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.49 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.7 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.88 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.49 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.49 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.49 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 435 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25.48 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  23.47 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  21.67 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.19 
 
 		 385 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.19 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.19 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 474 aa  46.6  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  22.28 
 
 		 413 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  32.91 
 
 		 917 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.38 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.78 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  23.38 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.67 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  32.93 
 
 		 893 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  23.38 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.69 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1544  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 189 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  25.3 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.82 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  22.51 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  27.94 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 474 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  25.35 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  33.73 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.55 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.55 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  23.55 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.08 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  21.34 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  34.68 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  34.68 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  34.68 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.91 
 
 		 422 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 434 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 432 aa  43.1  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>