137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0017 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  100 
 
 
215 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  80.47 
 
 
215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  47.15 
 
 
204 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  38 
 
 
228 aa  144  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  37.2 
 
 
228 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  35.75 
 
 
206 aa  138  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  38.34 
 
 
212 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  37.75 
 
 
217 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  40.93 
 
 
237 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  36.23 
 
 
235 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  37.06 
 
 
208 aa  134  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  37.06 
 
 
208 aa  134  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  39.27 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  36.79 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  39.38 
 
 
257 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  38.86 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  36.65 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  36.41 
 
 
204 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  36.79 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  39.38 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  36.79 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  40.31 
 
 
209 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  35.23 
 
 
204 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  35.9 
 
 
204 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  36.98 
 
 
233 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  32.98 
 
 
222 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  32.98 
 
 
222 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  34.03 
 
 
234 aa  121  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  35.6 
 
 
210 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  36.98 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  34.72 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  37.17 
 
 
200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  34.11 
 
 
215 aa  118  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  36.79 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  34.72 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  37.82 
 
 
212 aa  115  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  34.72 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  35.08 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  37.5 
 
 
202 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  31.94 
 
 
210 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  35.08 
 
 
201 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  38.74 
 
 
211 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  36.21 
 
 
217 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  31.94 
 
 
203 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  33.99 
 
 
214 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  33.33 
 
 
205 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  33.51 
 
 
202 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  29.53 
 
 
237 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  36.6 
 
 
211 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  35.53 
 
 
239 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  36.92 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  34.47 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  33.52 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  30 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  31.11 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  31.18 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  29.24 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  29.82 
 
 
323 aa  68.2  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  30 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  29.71 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  28.49 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  31.37 
 
 
293 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  29.38 
 
 
292 aa  62.4  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  25.41 
 
 
287 aa  62.4  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  26.7 
 
 
285 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  30.11 
 
 
283 aa  59.7  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  26.14 
 
 
285 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  25.13 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  28.11 
 
 
281 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  24.53 
 
 
288 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  34.74 
 
 
109 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  28.24 
 
 
296 aa  55.1  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  30.88 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0536  hypothetical protein  24.48 
 
 
288 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  24.18 
 
 
294 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  25.95 
 
 
290 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0967  hypothetical protein  26.19 
 
 
281 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  26.4 
 
 
287 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1873  protein of unknown function DUF161  32.64 
 
 
288 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.83834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  26.35 
 
 
288 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0930  hypothetical protein  30.43 
 
 
281 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0214742  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0780  hypothetical protein  25.67 
 
 
293 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0139128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3010  hypothetical protein  28.99 
 
 
292 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0879703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1039  hypothetical protein  31.97 
 
 
315 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  28.78 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  26.92 
 
 
304 aa  49.7  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1994  hypothetical protein  27.32 
 
 
290 aa  49.7  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000553659  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2543  hypothetical protein  30.77 
 
 
290 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  25.68 
 
 
289 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3548  protein of unknown function DUF161  30.77 
 
 
287 aa  48.5  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.979757 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0907  hypothetical protein  27.22 
 
 
296 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00009581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2074  hypothetical protein  25.17 
 
 
281 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1475  protein of unknown function DUF161  23.42 
 
 
286 aa  47  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3231  hypothetical protein  25.17 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.581359 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1764  hypothetical protein  26.25 
 
 
277 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00787569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0760  hypothetical protein  31.65 
 
 
287 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>