145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0198 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  100 
 
 
211 aa  410  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  94.79 
 
 
211 aa  358  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  81.52 
 
 
211 aa  306  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  59.61 
 
 
210 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  62.14 
 
 
214 aa  235  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  57.64 
 
 
210 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  55.78 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  53.61 
 
 
212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  54.64 
 
 
208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  54.64 
 
 
208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  52.82 
 
 
209 aa  206  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  50 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  49.52 
 
 
211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  50.76 
 
 
228 aa  199  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  46.97 
 
 
204 aa  198  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  46.73 
 
 
204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  50.25 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  57.73 
 
 
209 aa  194  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  49.22 
 
 
204 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  47.18 
 
 
222 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  47.18 
 
 
222 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  45.45 
 
 
204 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  49.49 
 
 
204 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  52.08 
 
 
237 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  47.5 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  47.98 
 
 
201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  51.3 
 
 
215 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  47.21 
 
 
200 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  47.21 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  45.45 
 
 
257 aa  174  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  42.93 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  50.26 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  44.95 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  53.81 
 
 
239 aa  170  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  44.85 
 
 
233 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  45.13 
 
 
234 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  47.15 
 
 
211 aa  168  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  43.81 
 
 
208 aa  167  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  41.24 
 
 
206 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  44.04 
 
 
202 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  42.86 
 
 
202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  46.67 
 
 
203 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  44.04 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  42.86 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  41.97 
 
 
237 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  46.11 
 
 
202 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  41.03 
 
 
203 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  46.07 
 
 
202 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  47.12 
 
 
233 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  39.9 
 
 
198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  43.01 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  42.13 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  40 
 
 
217 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  35.57 
 
 
215 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  34.47 
 
 
215 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  34.36 
 
 
204 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  47.33 
 
 
200 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  41.01 
 
 
229 aa  95.1  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  43.16 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  32.54 
 
 
281 aa  74.7  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  31.74 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  31.93 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  30.25 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  30.46 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  27.23 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  29.82 
 
 
314 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  26.29 
 
 
285 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  32.52 
 
 
288 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  30.19 
 
 
283 aa  62  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  27.46 
 
 
295 aa  61.6  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  28.32 
 
 
322 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  26.42 
 
 
285 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  28.8 
 
 
289 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0017  hypothetical protein  29.08 
 
 
269 aa  58.5  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  28.85 
 
 
287 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  29.34 
 
 
290 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  26.04 
 
 
299 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  28.16 
 
 
296 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  30.46 
 
 
296 aa  55.1  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  29.05 
 
 
311 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  28.92 
 
 
302 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  29.75 
 
 
290 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2836  protein of unknown function DUF161  34.31 
 
 
281 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  30.51 
 
 
292 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  27.68 
 
 
313 aa  54.3  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  25.15 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  30.19 
 
 
290 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2046  protein of unknown function DUF161  26.95 
 
 
301 aa  51.6  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.302347  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  26.53 
 
 
311 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  29.09 
 
 
309 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  26.28 
 
 
288 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  27.85 
 
 
289 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  32.47 
 
 
278 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  28.99 
 
 
323 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  25 
 
 
287 aa  48.9  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2862  protein of unknown function DUF161  28.14 
 
 
287 aa  48.9  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  27.81 
 
 
283 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  26.7 
 
 
278 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2185  hypothetical protein  27.78 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0743  hypothetical protein  28.24 
 
 
279 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108912  hitchhiker  0.0000688961 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>