133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03480 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  53.59 
 
 
204 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  51.72 
 
 
204 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  51.72 
 
 
204 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  50.25 
 
 
204 aa  211  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  50.77 
 
 
222 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  50.77 
 
 
222 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  50.52 
 
 
208 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  50.52 
 
 
208 aa  191  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  50 
 
 
215 aa  191  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  50 
 
 
212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  44.23 
 
 
257 aa  179  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  45.5 
 
 
206 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  41.83 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  48.72 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  43.75 
 
 
217 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  48.19 
 
 
210 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  45.41 
 
 
235 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  49.22 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  47.78 
 
 
204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  46.15 
 
 
202 aa  171  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  46.8 
 
 
211 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  45.69 
 
 
233 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  48.19 
 
 
214 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  45.81 
 
 
215 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  43.88 
 
 
203 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  46.34 
 
 
200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  44.28 
 
 
203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  44.72 
 
 
201 aa  164  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  45.88 
 
 
202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  47.15 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  42.78 
 
 
202 aa  157  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  39.11 
 
 
238 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  42.03 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  46.6 
 
 
237 aa  151  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  44.79 
 
 
234 aa  151  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  43.2 
 
 
228 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  43.2 
 
 
228 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  48.19 
 
 
211 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  44.5 
 
 
209 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  47.15 
 
 
211 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  47.15 
 
 
211 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  45.31 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  46.07 
 
 
237 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  39.59 
 
 
202 aa  138  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  40.31 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  34.43 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  41.88 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  44.72 
 
 
239 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  37.82 
 
 
205 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  41.24 
 
 
212 aa  122  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  36.79 
 
 
215 aa  121  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  38.14 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  36.79 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  33.82 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  37.78 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  43.4 
 
 
109 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  34.78 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  30.64 
 
 
296 aa  62  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  26.44 
 
 
294 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  27.27 
 
 
281 aa  59.3  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  25.95 
 
 
311 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  27.37 
 
 
292 aa  57  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  27.01 
 
 
322 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  25.54 
 
 
290 aa  55.5  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  30 
 
 
288 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  28.17 
 
 
288 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  26.85 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  24.69 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  24.73 
 
 
298 aa  53.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  31.82 
 
 
287 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  30.06 
 
 
288 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  26.95 
 
 
285 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  27.03 
 
 
285 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3006  protein of unknown function DUF161  28.33 
 
 
286 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000192497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  24.34 
 
 
292 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  29.73 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  24.74 
 
 
306 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  27.54 
 
 
279 aa  48.9  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  24.36 
 
 
311 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0209  protein of unknown function DUF161  28.19 
 
 
295 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.951556  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1873  protein of unknown function DUF161  27.71 
 
 
288 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.83834  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1380  hypothetical protein  25.95 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000107649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  23.93 
 
 
293 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  27.82 
 
 
295 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  25.6 
 
 
278 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  23.31 
 
 
293 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  23.08 
 
 
287 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  27.94 
 
 
297 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  25.68 
 
 
323 aa  45.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  26.56 
 
 
283 aa  45.1  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  28.89 
 
 
314 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  22.62 
 
 
293 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  22.62 
 
 
293 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  22.62 
 
 
293 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  29.52 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  27.49 
 
 
283 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  22.62 
 
 
293 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  27.54 
 
 
296 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>